SAXSdb — 2bl0

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN

PHYSARUM POLYCEPHALUM

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN × 1 （P08053） MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN × 1 （Q8WSQ4） CALCIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9BJD3_PHYPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–63； UniProt 778–840

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

PHYSARUM POLYCEPHALUM

UniProt P08053

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN × 1 （Q9BJD3） MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN × 1 （Q8WSQ4） CALCIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MLR_PHYPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

PHYSARUM POLYCEPHALUM

UniProt Q8WSQ4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN × 1 （Q9BJD3） MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN × 1 （P08053） CALCIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8WSQ4_PHYPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–142； UniProt 14–155

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2bl0
沉积日期 deposition_date	2005-02-23
结构标题 title	Physarum polycephalum myosin II regulatory domain
关键词 keywords	MUSCLE PROTEIN, SLIME MOULD, EF-HAND, MYOSIN; MUSCLE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2bl0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2bl0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2bl0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.74 Å
Rg（电子密度）	27.52 Å
总 Rg	28.10 Å
原子数	2776
残基数	350
排除体积	49423 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2bl0__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN
分子量 formula_weight	7577.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.32
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3078

RRIGEIVKVVQAAARGWVERKHFRQAREKSVSARIIQDNIRAYLEFKNWAWWKLFAKARPLLV

来源 Source

来源生物 organism	PHYSARUM POLYCEPHALUM
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5791
宿主生物 host_organism	ESCHERICIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN
分子量 formula_weight	15937.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.32
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

TASADQIQECFQIFDKDNDGKVSIEELGSALRSLGKNPTNAELNTIKGQLNAKEFDLATFKTVYRKPIKTPTEQSKEMLDAFRALDKEGNGTIQEAELRQLLLNLGDALTSSEVEELMKEVSVSGDGAINYESFVDMLVTGYPLA

来源 Source

来源生物 organism	PHYSARUM POLYCEPHALUM
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5791
宿主生物 host_organism	ESCHERICIA COLI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN
分子量 formula_weight	16195.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.32
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GDDQVSEFKEAFELFDSERTGFITKEGLQTVLKQFGVRVEPAAFNEMFNEADATGNGKIQFPEFLSMMGRRMKQTTSEDILRQAFRTFDPEGTGYIPKAALQDALLNLGDRLKPHEFAEFLGITETEKGQIRYDNFINTMFT

来源 Source

来源生物 organism	PHYSARUM POLYCEPHALUM
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5791
宿主生物 host_organism	ESCHERICIA COLI

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	230

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2bl0c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	2bl0A00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	270 — Myosin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Myosin, subunit A

结构域编号 domain_id	2bl0B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2bl0B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2bl0C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2bl0C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

▶

晶胞边长 a length_a	55.574 Å
晶胞边长 b length_b	70.858 Å
晶胞边长 c length_c	97.877 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.750 Å
最低分辨率 resolution_low	57.740 Å
R 因子 r_factor	0.2210
R_work r_work	0.2190
R_free r_free	0.2520

Physarum polycephalum myosin II regulatory domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bl0__assembly_1__model_1

2bl0__assembly_1__model_1 | I(q)

2bl0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Physarum polycephalum myosin II regulatory domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MYOSIN REGULATORY LIGHT CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bl0__assembly_1__model_1

2bl0__assembly_1__model_1 | I(q)

2bl0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)