SAXSdb — 2bsf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGMA C CAPSID PROTEIN

AVIAN REOVIRUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	SULFATE ION × 9 ZINC ION × 3 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O12287_REOV9
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–176； UniProt 151–326

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2bsf
沉积日期 deposition_date	2005-05-20
结构标题 title	Structure of the C-terminal receptor-binding domain of avian reovirus fibre sigmaC, Zn crystal form.
关键词 keywords	ORTHOREOVIRUS, TRIPLE BETA-SPIRAL, BETA-BARREL, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2bsf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2bsf__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2bsf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.73 Å
Rg（电子密度）	25.80 Å
总 Rg	26.75 Å
原子数	4026
残基数	528
排除体积	70394 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2bsf__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SIGMA C CAPSID PROTEIN
分子量 formula_weight	18912.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1506

SLESTASHGLSFSPPLSVADGVVSLDMDPYFCSQRVSLTSYSAEAQLMQFRWMARGTNGSSDTIDMTVNAHCHGRRTDYMMSSTGNLTVTSNVVLLTFDLSDITHIPSDLARLVPSAGFQAASFPVDVSFTRDSATHAYQAYGVYSSSRVFTITFPTGGDGTANIRSLTVRTGIDT

来源 Source

来源生物 organism	AVIAN REOVIRUS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	38170
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	164

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2bsfA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	25 — Laminin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — reovirus attachment protein sigma1; domain 1

结构域编号 domain_id	2bsfA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

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7. 引用文献 (7)

Structure of the Carboxy-Terminal Receptor-Binding Domain of Avian Reovirus Fibre Sigmac

J.Mol.Biol. (2005)

PMID: 16236316 · DOI: 10.1016/J.JMB.2005.09.034 PRIMARY

Crystallisation of the C-Terminal Globular Domain of Avian Reovirus Fibre

Acta Crystallogr.,Sect.F (2005)

PMID: 16511119 · DOI: 10.1107/S1744309105016933

Crystal Structure of Reovirus Attachment Protein Sigma1 Reveals Evolutionary Relationship to Adenovirus Fiber

Embo J. (2002)

PMID: 11782420 · DOI: 10.1093/EMBOJ/21.1.1

Subunit Composition and Conformational Stability of the Oligomeric Form of the Avian Reovirus Cell-Attachment Protein Sigmac

J.Gen.Virol. (2002)

PMID: 11752709 · DOI: 10.1099/0022-1317-83-1-131

;The Avian Reovirus Genome Segment S1 is a Functionally Tricistronic Gene that Expresses One Structure and Two Nonstructural Proteins in Infected Cells ;

Virology (2001)

PMID: 11883183 · DOI: 10.1006/VIRO.2001.1159

Oligomerization and Cell-Binding Properties of the Avian Reovirus Cell-Attachment Protein Sigmac

Virology (2000)

PMID: 10964779 · DOI: 10.1006/VIRO.2000.0473

Protein Architecture of Avian Reovirus S1133 and Identification of the Cell Attachment Protein

J.Virol. (1997)

PMID: 8985323

晶胞边长 a length_a	74.777 Å
晶胞边长 b length_b	74.777 Å
晶胞边长 c length_c	74.639 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 3 2 1
空间群编号 int_tables_number	150
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	74.540 Å
R 因子 r_factor	0.1670
R_work r_work	0.1610
R_free r_free	0.2230

Structure of the C-terminal receptor-binding domain of avian reovirus fibre sigmaC, Zn crystal form.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGMA C CAPSID PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bsf__assembly_1__model_1

2bsf__assembly_1__model_1 | I(q)

2bsf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (7)

Structure of the C-terminal receptor-binding domain of avian reovirus fibre sigmaC, Zn crystal form.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGMA C CAPSID PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2bsf__assembly_1__model_1

2bsf__assembly_1__model_1 | I(q)

2bsf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (7)