2c2v

Crystal structure of the CHIP-UBC13-UEV1a complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 225.8 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 2–152 链 H； UniProt 2–152	未记录	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 2 （Q13404） STIP1 homology and U box-containing protein 1 × 2 （Q9WUD1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 2–152 链 K； UniProt 2–152	未记录	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 2 （Q13404） STIP1 homology and U box-containing protein 1 × 2 （Q9WUD1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2C2V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1J7D Crystal Structure of hMms2-hUbc13 提交 2001-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG 8000, 100mM Citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.85 Å R-free 0.244
3HCT Crystal structure of TRAF6 in complex with Ubc13 in the P1 space group 提交 2009-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；8% PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
3HCU Crystal structure of TRAF6 in complex with Ubc13 in the C2 space group 提交 2009-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）片段：Ubc13	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；16-20% PEG 4000, 0.2M Magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.333
3HCU Crystal structure of TRAF6 in complex with Ubc13 in the C2 space group 提交 2009-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–152（152 aa）片段：Ubc13	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；16-20% PEG 4000, 0.2M Magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.333
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 X 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 b 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 e 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 14 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 g 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 15 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 i 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 16 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 l 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 17 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 n 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 18 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 p 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Q 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3VON Crystalstructure of the ubiquitin protease 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 U 3–150（148 aa）片段：UNP residues 3-150	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；90mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 19% PEG 3350, 10mM EDTA sodium salt, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.281
3W31 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	IOD IODIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.4M potassium iodide, 0.1M MES (pH6.5), 4mM DTT, 15% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.96 Å R-free 0.284
4DHI Structure of C. elegans OTUB1 bound to human UBC13 提交 2012-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate, 1 M trisodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.209
4DHJ The structure of a ceOTUB1 ubiquitin aldehyde UBC13~Ub complex 提交 2012-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG350, 0.26-0.30 M sodium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4DHJ The structure of a ceOTUB1 ubiquitin aldehyde UBC13~Ub complex 提交 2012-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG350, 0.26-0.30 M sodium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4DHJ The structure of a ceOTUB1 ubiquitin aldehyde UBC13~Ub complex 提交 2012-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG350, 0.26-0.30 M sodium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4DHJ The structure of a ceOTUB1 ubiquitin aldehyde UBC13~Ub complex 提交 2012-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 N 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG350, 0.26-0.30 M sodium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4DHZ The structure of h/ceOTUB1-ubiquitin aldehyde-UBC13~Ub 提交 2012-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；21% PEG10000, 0.1 M sodium chloride, 100 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.11 Å R-free 0.288
4IP3 Complex structure of OspI and Ubc13 提交 2013-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；0.2 M Sodium thiocyanate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
4NR3 Crystal Structure of a human Mms2/Ubc13 L121G mutant 提交 2013-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–150（149 aa）	突变：L121G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；20% PEG 8000, 0.1 M sodium citrate, pH 6.8, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.234
4NRG Crystal Structure of a human Mms2/Ubc13 D118G mutant 提交 2013-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	突变：D118G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；20% PEG 8000, 0.1 M sodium citrate, pH 6.8, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.211
4NRI Crystal Structure of a human Mms2/Ubc13 A122G mutant 提交 2013-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–150（148 aa）	突变：A122G	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；20% PEG 8000, 0.1 M sodium citrate, pH 6.8, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
4ONL Crystal structure of human Mms2/Ubc13_D81N, R85S, A122V, N123P 提交 2014-01-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；100 mM sodium citrate, 15% PEG 8000, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.199
4ONM Crystal structure of human Mms2/Ubc13 - NSC697923 提交 2014-01-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 N2F 2-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-5-nitrofuran × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；100 mM sodium citrate, 15% PEG 8000, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.192
4ONN Crystal structure of human Mms2/Ubc13 - BAY 11-7082 提交 2014-01-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 BY1 3-[(4-methylphenyl)sulfonyl]prop-2-enenitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；100 mM sodium citrate, 15% PEG 8000, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.213
4ORH Crystal structure of RNF8 bound to the UBC13/MMS2 heterodimer 提交 2014-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；75 mM Sodium Acetate, 1.0 M Ammonium Phosphate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.80 Å R-free 0.282
4ORH Crystal structure of RNF8 bound to the UBC13/MMS2 heterodimer 提交 2014-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；75 mM Sodium Acetate, 1.0 M Ammonium Phosphate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.80 Å R-free 0.282
4ORH Crystal structure of RNF8 bound to the UBC13/MMS2 heterodimer 提交 2014-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；75 mM Sodium Acetate, 1.0 M Ammonium Phosphate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.80 Å R-free 0.282
4TKP Complex of Ubc13 with the RING domain of the TRIM5alpha retroviral restriction factor 提交 2014-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–152（151 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris	分辨率 2.08 Å R-free 0.255
4WHV E3 ubiquitin-protein ligase RNF8 in complex with Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N and Polyubiquitin-B 提交 2014-09-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–152（152 aa）片段：unp residues 1-152 链 E 1–152（152 aa）片段：unp residues 1-152	突变：C87K 突变：C87K	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.04 M (NH4)2HPO4	分辨率 8.30 Å R-free 0.337
4WHV E3 ubiquitin-protein ligase RNF8 in complex with Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N and Polyubiquitin-B 提交 2014-09-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 1–152（152 aa）片段：unp residues 1-152 链 K 1–152（152 aa）片段：unp residues 1-152	突变：C87K 突变：C87K	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.04 M (NH4)2HPO4	分辨率 8.30 Å R-free 0.337
5AIT A complex of of RNF4-RING domain, UbeV2, Ubc13-Ub (isopeptide crosslink) 提交 2015-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–152（152 aa）链 E 1–152（152 aa）	突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.286
5AIU A complex of RNF4-RING domain, Ubc13-Ub (isopeptide crosslink) 提交 2015-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–152（152 aa）链 E 1–152（152 aa）	突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1,2-ETHANEDIOL	分辨率 2.21 Å R-free 0.255
5EYA TRIM25 RING domain in complex with Ubc13-Ub conjugate 提交 2015-11-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–152（152 aa）链 B 1–152（152 aa）	突变：C87K 突变：C87K	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Li citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.228
5H7S Structural basis of the flanking zinc-finger motifs crucial for the E3 ligase activity of the LNX1 RING domain 提交 2016-11-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–152（152 aa）链 C 1–152（152 aa）	突变：C87K, K92A 突变：C87K, K92A	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane, pH 6.4, 20% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 3.49 Å R-free 0.286
5VNZ Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；289 K；0.05-0.3 mM sodium citrate, 100 mM bBis-Tris propane, and 17-23% PEG 3350	分辨率 3.41 Å R-free 0.294
5VNZ Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；289 K；0.05-0.3 mM sodium citrate, 100 mM bBis-Tris propane, and 17-23% PEG 3350	分辨率 3.41 Å R-free 0.294
5VO0 Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–152（152 aa）链 E 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；100-200 mM Na/K tartrate, 11-15% PEG 3350 and 100 mM bis-Tris propane pH 7.5	分辨率 3.90 Å R-free 0.299
5YWR Crystal Structure of RING E3 ligase ZNRF1 in complex with Ube2N (Ubc13) 提交 2017-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–152（152 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2M Magnesium fromate dihydrate, 20% PEG 3350 (w/v)	分辨率 1.47 Å R-free 0.184
6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 3–152（150 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.296
6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 3–152（150 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.296
6JKY Crystal structure of MvcA-UBE2N-Ub complex from Legionella pneumophila 提交 2019-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	突变：K94A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Sodium thiocyanate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.45 Å R-free 0.258
6JKY Crystal structure of MvcA-UBE2N-Ub complex from Legionella pneumophila 提交 2019-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–152（152 aa）	突变：K94A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Sodium thiocyanate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.45 Å R-free 0.258
6KFP Crystal structure of MavC ternary complex 提交 2019-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, lithium chloride	分辨率 2.92 Å R-free 0.250
6KG6 Crystal structure of MavC/UBE2N-Ub complex 提交 2019-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 4000, Tris	分辨率 2.39 Å R-free 0.245
6KL4 Crystal structure of MavC-UBE2N-Ub 提交 2019-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	突变：K94A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；289.15 K；0.2M Sodium malonate pH 6.0, 20%w/v PEG 3,350	分辨率 2.85 Å R-free 0.262
6LP2 Structure of Lpg2148/UBE2N-Ub complex 提交 2020-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, potassium citrate	分辨率 2.48 Å R-free 0.233
6P5B Crystal Structure of MavC in Complex with Ub-UbE2N 提交 2019-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；0.2 M Na Malonate, 25% PEG 3350, 10 mM NiCl2	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
6S53 Crystal structure of TRIM21 RING domain in complex with an isopeptide-linked Ube2N~ubiquitin conjugate 提交 2019-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–152（152 aa）链 E 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；Crystals grew in 0.1 M Tris/BICINE pH 8.5, 10.5 % (w/v) PEG3350/PEG 1K/MPD and 0.08 M sodium nitrate/sodium phosphate/ammonium sulfate.	分辨率 2.80 Å R-free 0.249
6S53 Crystal structure of TRIM21 RING domain in complex with an isopeptide-linked Ube2N~ubiquitin conjugate 提交 2019-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 1–152（152 aa）链 K 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；Crystals grew in 0.1 M Tris/BICINE pH 8.5, 10.5 % (w/v) PEG3350/PEG 1K/MPD and 0.08 M sodium nitrate/sodium phosphate/ammonium sulfate.	分辨率 2.80 Å R-free 0.249
6ULH Structure of MavC in complex with its substrate in R3 spacegroup 提交 2019-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；0.1 M Sodium Acetate: HCl, pH 4.6 3.5 M Sodium Formate	分辨率 1.97 Å R-free 0.227
6UMP Crystal structure of MavC in complex with substrate mimic in P65 space group 提交 2019-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Sodium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.80 Å R-free 0.304
6UMS Crystal structure of MavC in complex with its substrate mimic in C222(1) space group 提交 2019-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.15 M Potassium bromide, 30% (w/v) PEG 2000 MME	分辨率 2.34 Å R-free 0.250
7BBD Crystal structure of monoubiquitinated TRIM21 RING (Ub-RING) In complex with ubiquitin charged Ube2N (Ube2N~Ub) and Ube2V2 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–152（152 aa）	突变：C87K, K92A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290.15 K；MOPSO, Bis-Tris, PEG 4K, 1,2,6-hexanetriol, Li, Na, K	分辨率 2.20 Å R-free 0.252
7BBF Crystal structure of ubiquitin charged Ube2N (Ube2N~Ub) in complex with Ube2V2 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–152（152 aa）链 D 1–152（152 aa）链 G 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M bicine Trizma base pH 8.5, 12.5% PEG 1000, 12.5% PEG 3350, 12.5% MPD, 0.2 % of each Anesthetic alkaloids (lidocaine HCl H2O, procaine HCl, proparacaine HCl, tetracaine HCl)	分辨率 2.54 Å R-free 0.253
7BXG MavC-UBE2N-Ub complex 提交 2020-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M sodium malonate, pH 7.0, 12% PEG3350	分辨率 2.71 Å R-free 0.243
9BIV Crystal Structure of Ubc13 with a New Active Site Loop Conformation 提交 2024-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.5；298 K；Ubc13-Mms2 heterodimer was concentrated to 12 mg/mL and stored in 50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 1mM TCEP. Complex was left to slowly equilibrate from 277K to 298 overnight	分辨率 1.68 Å R-free 0.177
9LHJ UBE2N/UBE2V2 complexed with a covalent inhibitor 提交 2025-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–152（152 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 20% w/v PEG 5,000	分辨率 1.68 Å R-free 0.228
9LHJ UBE2N/UBE2V2 complexed with a covalent inhibitor 提交 2025-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 20% w/v PEG 5,000	分辨率 1.68 Å R-free 0.228
9N1F Crystal Structure of the Ark2C-Ubc13~Ub-Mms2 complex 提交 2025-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–152（152 aa）	突变：C87K, K92T, K94Q	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M Sodium Malonate and 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.279
9UV6 Encounter complex structure of E2N and Ubiquitin 提交 2025-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–152（150 aa）	突变：N123C	A1EQF (5~{S},16~{S})-16-[2-[2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-1-yl]ethylamino]-2,11,12,17-tetraoxa-5,8-diaza-1$l^{4}-manganatricyclo[6.3.3.3^{1,5}]heptadecane-3,10,13-trione × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1 NMR样品组成 0.6 mM [U-15N] Ubi, 0.2 mM E2N, 20 mM HEPES, 90 % H2O, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBE2N_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–154； UniProt 2–152 作者链 E； PDB构建体 4–154； UniProt 2–152 作者链 H； PDB构建体 4–154； UniProt 2–152 作者链 K； PDB构建体 4–154； UniProt 2–152

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1

Homo sapiens

UniProt Q13404

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 80–221 链 I； UniProt 80–221	未记录	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 2 （P61088） STIP1 homology and U box-containing protein 1 × 2 （Q9WUD1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 80–221 链 L； UniProt 80–221	未记录	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 2 （P61088） STIP1 homology and U box-containing protein 1 × 2 （Q9WUD1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2C2V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2A4D Structure of the human ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 (UEV-1) 提交 2005-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 81–221（141 aa）片段：catalytic domain, residues 82-220	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；298 K；32% PEG1500, 0.2 M NaCl, 1 mM DTT, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.50	分辨率 1.69 Å R-free 0.240
2HLW Solution Structure of the Human Ubiquitin-conjugating Enzyme Variant Uev1a 提交 2006-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 74–221（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM hUev1a U-15N,13C; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.75mM hUev1a U-15N,U-10% 13C; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5mM hUev1a U-15N; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 8–147（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.296
6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 8–147（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.296

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UB2V1_HUMAN
Isoform	Q13404-1
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–142； UniProt 80–221 作者链 F； PDB构建体 1–142； UniProt 80–221 作者链 I； PDB构建体 1–142； UniProt 80–221 作者链 L； PDB构建体 1–142； UniProt 80–221

STIP1 homology and U box-containing protein 1

Mus musculus

UniProt Q9WUD1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 227–304 链 T； UniProt 227–304	片段：C-TEMINAL DOMAIN, RESIDUES 227-304	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 2 （P61088） Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 2 （Q13404）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 227–304 链 V； UniProt 227–304	片段：C-TEMINAL DOMAIN, RESIDUES 227-304	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 2 （P61088） Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 2 （Q13404）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).	分辨率 2.90 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2C2V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3Q47 Crystal structure of TPR domain of CHIP complexed with pseudophosphorylated Smad1 peptide 提交 2010-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–155（133 aa）片段：TPR domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；100mM Bis-tris propane pH 7.0, 41% PEG MME 2000, 50mM magnesium acetate, 50mM proline, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.71 Å R-free 0.192
3Q49 Crystal structure of the TPR domain of CHIP complexed with Hsp70-C peptide 提交 2010-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–155（133 aa）片段：TPR domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；100mM Bis-tris propane pH 7.0, 40% PEG MME 2000, 3% (w/v) xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.54 Å R-free 0.206
3Q4A Crystal structure of the TPR domain of CHIP complexed with phosphorylated Smad1 peptide 提交 2010-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–155（133 aa）片段：TPR domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；100mM Bis-tris propane pH 7.0, 40% PEG MME 2000, 1% PEG MME 550, 50mM magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.54 Å R-free 0.208

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHIP_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–78； UniProt 227–304 作者链 T； PDB构建体 1–78； UniProt 227–304 作者链 U； PDB构建体 1–78； UniProt 227–304 作者链 V； PDB构建体 1–78； UniProt 227–304

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2c2v
沉积日期 deposition_date	2005-09-30
结构标题 title	Crystal structure of the CHIP-UBC13-UEV1a complex
关键词 keywords	CHAPERONE, HEAT-SHOCK PROTEIN COMPLEX, E3 LIGASE, UBIQUITINYLATION, TPR, HEAT-SHOCK PROTEIN; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	70.64 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	72.13 Å
零角强度 I(0) i0	388140000.00
分子量 molecular_weight	164980.0 kDa
排除体积 excluded_volume	207290 Å³
包络体积 envelope_volume	366950 Å³
水化壳体积 shell_volume	51836 Å³
包络直径 envelope_diameter	250.2 Å
壳层 Rg shell_rg	49.74 Å
包络 Rg envelope_rg	73.27 Å
形状 Rg shape_rg	72.10 Å
总 Rg total_rg	71.50 Å
总原子数 total_atoms	11601
残基数 n_residues	1458
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	225.8 Å
Rg (实空间) rg_real	71.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.24 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8750e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.3980e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	67.10 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	384900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7311
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	41.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.601
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.445
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0055
最高正则化参数 α highest_alpha	11810000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.344; Stabil: 0.996; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.569; Smooth: 0.906

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N
分子量 formula_weight	17241.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.23
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E,H,K
原子数 atom_count	11636

AGSAGLPRRIIKETQRLLAEPVPGIKAEPDESNARYFHVVIAGPQDSPFEGGTFKLELFLPEEYPMAAPKVRFMTKIYHPNVDKLGRICLDILKDKWSPALQIRTVLLSIQALLSAPNPDDPLANDVAEQWKTNEAQAIETARAWTRLYAMNNI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1
分子量 formula_weight	16095.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I,L

TTGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMILGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	STIP1 homology and U box-containing protein 1
分子量 formula_weight	9033.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.27
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,T,U,V

DIPDYLCGKISFELMREPCITPSGITYDRKDIEEHLQRVGHFNPVTRSPLTQEQLIPNLAMKEVIDAFISENGWVEDY

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	35

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_id	d2c2vb2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vb3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2c2vc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2ve_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vf_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vh_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vi_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vk2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vk3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2c2vl_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.20 — UBC-like
超家族 Superfamily superfamily	d.20.1 — UBC-like
家族 Family family	d.20.1.1 — UBC-related

结构域编号 domain_id	d2c2vs1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.44 — RING/U-box
超家族 Superfamily superfamily	g.44.1 — RING/U-box
家族 Family family	g.44.1.2 — U-box

结构域编号 domain_id	d2c2vt_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.44 — RING/U-box
超家族 Superfamily superfamily	g.44.1 — RING/U-box
家族 Family family	g.44.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2c2vu_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.44 — RING/U-box
超家族 Superfamily superfamily	g.44.1 — RING/U-box
家族 Family family	g.44.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2c2vv_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.44 — RING/U-box
超家族 Superfamily superfamily	g.44.1 — RING/U-box
家族 Family family	g.44.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	2c2vB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme

结构域编号 domain_id	2c2vS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	2c2vT00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	2c2vU00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

结构域编号 domain_id	2c2vV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	180.310 Å
晶胞边长 b length_b	69.991 Å
晶胞边长 c length_c	204.477 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.95 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	196.120 Å
R 因子 r_factor	0.2180
R_work r_work	0.2140
R_free r_free	0.2970

Crystal structure of the CHIP-UBC13-UEV1a complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

STIP1 homology and U box-containing protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 26 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/c2/2c2v/2c2v.fit
pddf	/app/data/pr_computation/c2/2c2v/2c2v.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/c2/2c2v/2c2v.dat