SAXSdb — 2c7k

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phycoerythrocyanin alpha chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Phycoerythrocyanin beta chain × 3 （P00313） PHYCOCYANOBILIN × 9 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHEA_MASLA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

Phycoerythrocyanin beta chain

物种未注明

UniProt P00313

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Phycoerythrocyanin alpha chain × 3 （P00309） PHYCOCYANOBILIN × 9 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHEB_MASLA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2c7k
沉积日期 deposition_date	2005-11-24
结构标题 title	Laue structure of phycoerythrocyanin from Mastigocladus laminosus
关键词 keywords	;PHYCOERYTHROCYANIN, PHYCOVIOLOBILIN, PHYCOCYANOBILIN, BILE PIGMENT, CHROMOPHORE, ELECTRON TRANSPORT, PHOTOSYNTHESIS, PHYCOBILISOME, ANTENNA PROTEIN ;; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2c7k__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2c7k__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2c7k__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.55 Å
Rg（电子密度）	38.93 Å
总 Rg	39.27 Å
原子数	7989
残基数	1002
排除体积	141500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2c7k__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phycoerythrocyanin alpha chain
分子量 formula_weight	17581.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2849

MKTPLTEAIAAADLRGSYLSNTELQAVFGRFNRARAGLEAARAFANNGKKWAEAAANHVYQKFPYTTQMQGPQYASTPEGKAKCVRDIDHYLRTISYCCVVGGTGPLDDYVVAGLKEFNSALGLSPSWYIAALEFVRDNHGLTGDVAGEANTYINYAINALS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Phycoerythrocyanin beta chain
分子量 formula_weight	18507.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MLDAFSRVVEQADKKGAYLSNDEINALQAIVADSNKRLDVVNRLTSNASSIVANAYRALVAERPQVFNPGGPCFHHRNQAACIRDLGFILRYVTYSVLAGDTSVMDDRCLNGLRETYQALGTPGDAVASGIKKMKEAALKIANDPNGITKGDCSQLMSELASYFDRAAAAVA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHYCOCYANOBILIN
分子量 formula_weight	588.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	186

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2c7kA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	2c7kB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

▶

晶胞边长 a length_a	156.745 Å
晶胞边长 b length_b	156.745 Å
晶胞边长 c length_c	40.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	50.300 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2860

Laue structure of phycoerythrocyanin from Mastigocladus laminosus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phycoerythrocyanin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phycoerythrocyanin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2c7k__assembly_1__model_1

2c7k__assembly_1__model_1 | I(q)

2c7k__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Laue structure of phycoerythrocyanin from Mastigocladus laminosus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phycoerythrocyanin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phycoerythrocyanin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2c7k__assembly_1__model_1

2c7k__assembly_1__model_1 | I(q)

2c7k__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)