SAXSdb — 2cjq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

BOVINE VIRAL DIARRHEA VIRUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_BVDVC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–438； UniProt 3189–3626 作者链 A； PDB构建体 440–720； UniProt 3627–3907

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2cjq
沉积日期 deposition_date	2006-04-05
结构标题 title	Bovine viral diarrhea virus CP7-R12 RNA-dependent RNA polymerase
关键词 keywords	;TRANSFERASE, RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE, NUCLEOTIDYLTRANSFERASE, BOVINE VIRAL DIARRHEA VIRUS, BVDV, HELICASE, MEMBRANE, PROTEASE, HYDROLASE, RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE, VIRAL POLYMERASE, NUCLEOTIDE-BINDING, TRANSMEMBRANE, THIOL PROTEASE, SERINE PROTEASE, ATP-BINDING, POLYPROTEIN, GLYCOPROTEIN ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2cjq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2cjq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2cjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.69 Å
Rg（电子密度）	25.63 Å
总 Rg	26.46 Å
原子数	4393
残基数	546
排除体积	78465 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2cjq__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE
分子量 formula_weight	82302.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4424

SSWFLQATNKQMSLTPLFEELLLRCPPKIKSNKGHMASAYQLAQGNWEPLDCGVHLGTIPARRVKIHPYEAYLKLKDLLEEEEKKPKCRDTVIREHNKWILKKVRHQGNLNTKKTLNPGKLSEQLDREGHKRNIYNNQIGTIMTEAGIRLEKLPVVRAQTDTKSFHEAIRDKIDKNENQQSPGLHDKLLEIFHTIAQPSLRHTYSDVTWEQLEAGVNRKGAAGFLEKKNVGEVLDSEKHLVEQLIRDLKTGRKIRYYETAIPKNEKRDVSDDWQSGDLVDEKKPRVIQYPEAKTRLAITKVMYNWVKQQPVVIPGYEGKTPLFNIFNKVRKEWDLFNEPVAVSFDTKNWDTQVTSRDLRLIGEIQKYYYRKEWHKFIDTITDHMVEVPVITADGEVYIRNGQRGSGQPDTSAGNSMLNVLTMMYAFCESTGVPYKSFNNRVARIHVCGDDGFLITEKGLGLKFANNGMQILHEAGKPQKITEGERMKVAYRFEDIEFCSHTPVPVRWSDNTSSYMAGRDTAVILSKMATRLDSSGERGTIAYEKAVAFSFLLMYSWNPLVRRICLLVLSQQPETTPSTQTTYYYKGDPIGAYKDVIGKNLCELKRTGFEKLANLNLSLSTLGIWSKHTSKRIIQDCVTIGKEEGNWLVNADRLISSKTGHLYIPDKGYTLQGKHYEQLQLQARTSPVTGVGTERYKLGPIVNLLLRRLRVLLMAAVGASS

来源 Source

来源生物 organism	BOVINE VIRAL DIARRHEA VIRUS
通用名 common_name	BVDV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11099
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	31

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2cjqa_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamily	e.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family family	e.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2cjqA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain

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晶胞边长 a length_a	106.244 Å
晶胞边长 b length_b	106.244 Å
晶胞边长 c length_c	55.387 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	3

空间群 space_group	P 31
空间群编号 int_tables_number	144
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2311
R_work r_work	0.2311
R_free r_free	0.2587

Bovine viral diarrhea virus CP7-R12 RNA-dependent RNA polymerase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2cjq__assembly_1__model_1

2cjq__assembly_1__model_1 | I(q)

2cjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Bovine viral diarrhea virus CP7-R12 RNA-dependent RNA polymerase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2cjq__assembly_1__model_1

2cjq__assembly_1__model_1 | I(q)

2cjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)