Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Ribonuclease P protein component 2 × 2 （O59150） octyl beta-D-glucopyranoside × 2 ACETIC ACID × 16 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RNP3_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–212； UniProt 1–212 作者链 B； PDB构建体 1–212； UniProt 1–212 |
Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Ribonuclease P protein component 3 × 2 （O59543） octyl beta-D-glucopyranoside × 2 ACETIC ACID × 16 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RNP2_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120 作者链 D； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120 |
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| 条目编号 entry_id | 2czv |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-07-19 |
| 结构标题 title | Crystal structure of archeal RNase P protein ph1481p in complex with ph1877p |
| 关键词 keywords | Ribonuclease, RNA binding protein, RNA recognition motif, Protein-protein complex, Hydrolase; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.58 Å |
| Rg（电子密度） | 28.84 Å |
| 总 Rg | 29.58 Å |
| 原子数 | 5449 |
| 残基数 | 651 |
| 排除体积 | 99267 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2czva_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.6 — 7-stranded beta/alpha barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.6.3 — PHP domain-like |
| 家族 Family family | c.6.3.2 — RNase P subunit p30 |
| 结构域编号 domain_id | d2czvb_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.6 — 7-stranded beta/alpha barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.6.3 — PHP domain-like |
| 家族 Family family | c.6.3.2 — RNase P subunit p30 |
| 结构域编号 domain_id | d2czvc1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.59 — Rnp2-like |
| 家族 Family family | d.58.59.1 — Rpp14/Pop5-like |
| 结构域编号 domain_id | d2czvd_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.59 — Rnp2-like |
| 家族 Family family | d.58.59.1 — Rpp14/Pop5-like |
| 结构域编号 domain_id | 2czvA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Metal-dependent hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2czvB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Metal-dependent hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2czvC01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3250 — Ribonuclease P, Pop5 subunit |
| 结构域编号 domain_id | 2czvD01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3250 — Ribonuclease P, Pop5 subunit |