2dpy

Crystal structure of the flagellar type III ATPase FliI

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellum-specific ATP synthase

Salmonella typhimurium

UniProt P26465

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLII_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–438; UniProt 19–456 作者链 B; PDB构建体 1–438; UniProt 19–456

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2dpy
沉积日期 deposition_date2006-05-18
结构标题 titleCrystal structure of the flagellar type III ATPase FliI
关键词 keywordsBETA BARREL, alpha-beta structure, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2dpy__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2dpy__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2dpy__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.23 Å
Rg(电子密度)24.74 Å
总 Rg25.36 Å
原子数3260
残基数426
排除体积58134 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2dpy__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2dpy__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2dpya1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamilyb.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familyb.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2dpya2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)
结构域编号 domain_idd2dpya3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familya.69.1.3 — C-terminal domain of Flagellar type III ATPase
结构域编号 domain_idd2dpyb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamilyb.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familyb.49.1.1 — N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase
结构域编号 domain_idd2dpyb2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)
结构域编号 domain_idd2dpyb3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family familya.69.1.3 — C-terminal domain of Flagellar type III ATPase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2dpyA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12240 —
结构域编号 domain_id2dpyB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
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7. 引用文献 (1)