Escherichia coli K12
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | MAGNESIUM ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | APT_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 8–190； UniProt 1–183 作者链 B； PDB构建体 8–190； UniProt 1–183 |
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| 条目编号 entry_id | 2dy0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-09-04 |
| 结构标题 title | Crystal structure of project JW0458 from Escherichia coli |
| 关键词 keywords | ;structural genomics, NPPSFA, National Project on Protein Structural and Functional Analyses, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.29 Å |
| Rg（电子密度） | 19.84 Å |
| 总 Rg | 20.82 Å |
| 原子数 | 2784 |
| 残基数 | 363 |
| 排除体积 | 50255 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2dy0a_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2dy0b_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2dy0A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 2020 — |
| 结构域编号 domain_id | 2dy0B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 2020 — |