Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*DAP*DGP*DTP*DGP*DAP*DAP*DAP*DAP*DTP*DTP*DTP*DTP*DTP*DCP*DAP*DCP*DA)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*DTP*DGP*DTP*DGP*DAP*DAP*DAP*DAP*DAP*DTP*DTP*DTP*DTP*DCP*DAP*DCP*DT)-3') ; × 1 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | REG6_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 21–171； UniProt 1–151 |
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| 条目编号 entry_id | 2e1c |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-10-24 |
| 结构标题 title | Structure of Putative HTH-type transcriptional regulator PH1519/DNA Complex |
| 关键词 keywords | DNA-binding, transcriptional regulatory protein, archaeal, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 2 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 25.70 Å |
| Rg（电子密度） | 24.11 Å |
| 总 Rg | 24.98 Å |
| 原子数 | 3001 |
| 残基数 | 328 |
| 排除体积 | 52214 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2e1ca1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.4.5.32 — Lrp/AsnC-like transcriptional regulator N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | d2e1ca2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.4 — Dimeric alpha+beta barrel |
| 家族 Family family | d.58.4.2 — Lrp/AsnC-like transcriptional regulator C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 2e1cA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 2e1cA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 920 — Lrp/AsnC effector binding domain/regulation of amino acid metabolism (RAM) domain |