Salmonella typhimurium
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | BIS(ADENOSINE)-5'-TETRAPHOSPHATE × 2 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | TDCD_SALTY |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 15–415； UniProt 2–402 |
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| 条目编号 entry_id | 2e20 |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-11-04 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD) in complex with diadenosine tetraphosphate (Ap4A) |
| 关键词 keywords | Propionate kinase, TdcD, Native, Acetate kinase, Nucleotide, Ap4A, ADP, ATP, AMPPNP, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 28.85 Å |
| Rg（电子密度） | 28.40 Å |
| 总 Rg | 28.97 Å |
| 原子数 | 5990 |
| 残基数 | 788 |
| 排除体积 | 105530 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2e20a1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.1 — Actin-like ATPase domain |
| 家族 Family family | c.55.1.2 — Acetokinase-like |
| 结构域编号 domain_id | d2e20a2 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.1 — Actin-like ATPase domain |
| 家族 Family family | c.55.1.2 — Acetokinase-like |
| 结构域编号 domain_id | 2e20A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — ATPase, nucleotide binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 2e20A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — ATPase, nucleotide binding domain |