2e7l

Structure of a high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 112.8 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytotoxic Tcell receptor

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–132	片段：UNP RESIDUES 21-132	Beta-chain × 1 （A2NTY6） H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain × 1 （P01897） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–132	片段：UNP RESIDUES 21-132	Beta-chain × 1 （A2NTY6） H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain × 1 （P01897） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A2NTU7_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–112； UniProt 21–132 作者链 B； PDB构建体 1–112； UniProt 21–132

Beta-chain

Mus musculus

UniProt A2NTY6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 30–144	片段：UNP RESIDUES 30-144	Cytotoxic Tcell receptor × 1 （A2NTU7） H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain × 1 （P01897） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 30–144	片段：UNP RESIDUES 30-144	Cytotoxic Tcell receptor × 1 （A2NTU7） H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain × 1 （P01897） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2E7L	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2OI9 Structure of the 2C/Ld/QL9 allogeneic complex 提交 2007-01-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 30–144（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；0.9M sodium dihydrogen phosphate, 0.01M di-potassium hydrogen phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.226
2PXY Crystal structures of immune receptor complexes 提交 2007-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 32–144（113 aa）	突变：G17E,H47Y,I75T,L78S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M succinic acid (pH7.0), 16% polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.23 Å R-free 0.253
2Z31 Crystal structure of immune receptor complex 提交 2007-05-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 32–144（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2M patassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M succinic acid, 16% polyethylene glycol 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.287
2Z35 Crystal structure of immune receptor 提交 2007-06-01	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 32–144（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.8M mono-sodium dihydrogen phosphate, 0.8M mono-potassium dihydrogen phosphate and 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
3MC0 Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a Mouse T-cell Receptor beta Chain 提交 2010-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 31–144（114 aa）片段：unp residues 31-144	未记录	ACT ACETATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；sodium acetate 1.4 M protein concentration 7.5 mg/ml, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.211
3MC0 Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a Mouse T-cell Receptor beta Chain 提交 2010-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 31–144（114 aa）片段：unp residues 31-144	未记录	ACT ACETATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；sodium acetate 1.4 M protein concentration 7.5 mg/ml, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.211
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 29–144（116 aa）片段：VARIABLE DOMAIN	突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
6MIV Crystal structure of the mCD1d/xxq (JJ300)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JU1 N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(4-tert-butylphenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.219
6MIY Crystal structure of the mCD1d/xxa (JJ239)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 JTV N-{(2S,3S,4R)-1-[(4-O-benzyl-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6MIY Crystal structure of the mCD1d/xxa (JJ239)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 29–123（95 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 2 JTV N-{(2S,3S,4R)-1-[(4-O-benzyl-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000	分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6MJ4 Crystal structure of MCD1D/INKTCR TERNARY COMPLEX bound to glycolipid (XXW) 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTG N-[(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-{[4-O-(prop-2-en-1-yl)-alpha-D-galactopyranosyl]oxy}octadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.214
6MJ6 Crystal structure of the mCD1d/xxx (JJ166) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 7 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTM N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(4-chlorophenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 2.45 Å R-free 0.234
6MJA Crystal structure of the mCD1d/xxo (JJ294) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTJ N-[(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-({4-O-[(4-methylphenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)octadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
6MJI Crystal structure of the mCD1d/xxs (JJ304) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTD N-[(2S,3S,4R)-1-{[4-O-(cyclopropylmethyl)-alpha-D-galactopyranosyl]oxy}-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.227
6MJJ Crystal structure of the mCD1d/xxm (JJ290) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 10 NA SODIUM ION × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JU4 N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 1.93 Å R-free 0.216
6MJQ Crystal structure of the mCD1d/xxp (JJ295) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JUD N-{(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-[(4-O-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]octadecan-2-yl}hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
6MJQ Crystal structure of the mCD1d/xxp (JJ295) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 29–123（95 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 JUD N-{(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-[(4-O-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]octadecan-2-yl}hexacosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
8T4Z T-cell receptor and lipid complex structure 提交 2023-06-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 29–123（95 aa）	未记录	Y73 N-[(2R,3R,4E)-1,3-dihydroxyoctadec-4-en-2-yl]tetracosanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；18-20% PEG3350, 8% Tacsimate pH 5.0	分辨率 2.69 Å R-free 0.265

共 15 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A2NTY6_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–110； UniProt 30–144 作者链 D； PDB构建体 1–110； UniProt 30–144

H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain

Mus musculus

UniProt P01897

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 25–205	片段：alpha 1,2 domains (UNP RESIDUES 25-205)	Cytotoxic Tcell receptor × 1 （A2NTU7） Beta-chain × 1 （A2NTY6） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 25–205	片段：alpha 1,2 domains (UNP RESIDUES 25-205)	Cytotoxic Tcell receptor × 1 （A2NTU7） Beta-chain × 1 （A2NTY6） Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2E7L	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1LD9 THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF AN H-2LD PEPTIDE COMPLEX EXPLAINS THE UNIQUE INTERACTION OF LD WITH BETA2M AND PEPTIDE 提交 1997-04-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 25–292（268 aa）片段：EXTRACELLULAR DOMAINS	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
1LD9 THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF AN H-2LD PEPTIDE COMPLEX EXPLAINS THE UNIQUE INTERACTION OF LD WITH BETA2M AND PEPTIDE 提交 1997-04-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 25–292（268 aa）片段：EXTRACELLULAR DOMAINS	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
1LDP CRYSTAL STRUCTURE OF MURINE MHC CLASS I H-2LD WITH A MIXTURE OF BOUND PEPTIDES 提交 1998-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 25–296（272 aa）片段：CHAIN H IS THE HEAVY CHAIN, PEPTIDE BINDING DOMAIN, CHAIN L IS THE LIGHT CHAIN OR BETA-2-MICROGLOBULIN	突变：HEAVY CHAIN TRUNCATED AFTER RESIDUE 274, B2M, LIGHT CHAIN TRUNCATED AFTER RESIDUE 99	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 100MM SODIUM CACODYLATE, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.5M SODIUM BROMIDE, 30% PEG 8000, PH 6.5.	分辨率 3.10 Å R-free 0.371
2OI9 Structure of the 2C/Ld/QL9 allogeneic complex 提交 2007-01-10	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）片段：alpha 1,2 domains	突变：F9Y, V12T, I23T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；0.9M sodium dihydrogen phosphate, 0.01M di-potassium hydrogen phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.226
3E2H Structure of the m67 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–199（175 aa）	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, R97W, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；2M ammonium tartrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 c 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 U 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3E3Q Structure of the 3alpham13 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 25–199（175 aa）片段：UNP residues 25-199	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, W97R, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium citrate, 20% PEG 3350, 3% trimethyl amine N-oxide dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.275
3UO1 Structure of a monoclonal antibody complexed with its MHC-I antigen 提交 2011-11-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 70–78（9 aa）片段：H-2L(d) PEPTIDE SEGMENT 46-54	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；antibody at 6.8 mg/ml mixed with equimolar peptide and then 1:1 with 0.1 M LiSO4, 0.1 M TRIS, 30% w/v PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.64 Å R-free 0.206
3UYR Structure of a monoclonal antibody complexed with its MHC-I antigen 提交 2011-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 70–77（8 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M LiSO4, 0.1M Tris pH 8.5, 30% (w/v) PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
3V4U Structure of a monoclonal antibody complexed with its MHC-I antigen 提交 2011-12-15	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 70–78（9 aa）片段：H-2L(d) PEPTIDE SEGMENT 46-54	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M LiSO4, 0.1M Tris, 30%(w/v)PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.64 Å R-free 0.251
3V52 Structure of a monoclonal antibody complexed with its MHC-I antigen 提交 2011-12-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 70–77（8 aa）片段：H-2Ld peptide p46-53	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M LiSO4, 0.1M Tris, 30% (w/v/) PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
3VJ6 Structure of the MHC class Ib molecule Qa-1b 提交 2011-10-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 3–11（9 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；6% PEG 4000, 10mM NiCl2, 0.1M sodium acetate, pH 6.3. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.242
4MS8 42F3 TCR pCPB9/H-2Ld Complex 提交 2013-09-18	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 100mM TRIS pH8, 200mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.219
4MVB 42F3 pCPB7/H-2Ld Complex 提交 2013-09-23	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）片段：UNP residues 25-203	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25% PEG 3350, 100mM BIS-TRIS pH 5.5 and 200mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.09 Å R-free 0.279
4MXQ 42F3 TCR pCPC5/H-2Ld Complex 提交 2013-09-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）片段：UNP residues 25-203	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 3350, 100mM BIS-TRIS, pH 7.0 and 200mM magnesium nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.240
4N0C 42F3 TCR pCPE3/H-2Ld complex 提交 2013-10-01	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）片段：UNP residues 25-203	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；17% PEG 3350 and 100mM BiS-TRIS, pH 6.6 and 200mM magnesium nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4N0C 42F3 TCR pCPE3/H-2Ld complex 提交 2013-10-01	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 25–203（179 aa）片段：UNP residues 25-203	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；17% PEG 3350 and 100mM BiS-TRIS, pH 6.6 and 200mM magnesium nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4N5E 42F3 TCR pCPA12/H-2Ld complex 提交 2013-10-09	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–203（179 aa）片段：UNP residues 25-203	突变：F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, K131R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16% PEG 3350, 100mM TRIS, pH 7.5 and 200mM magnesium nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.06 Å R-free 0.227
4NHU The M33 TCR p3M33l/H-2 Ld Complex 提交 2013-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 25–204（180 aa）	突变：N30D, A49V, I66V, W97R, K131R, W167A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Crystals grown in 20% PEG 3350 and 200mM Ammonium Nitrate and micro seeded into 20% PEG 3350 and 200mM Ammonium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.260
4NHU The M33 TCR p3M33l/H-2 Ld Complex 提交 2013-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 25–204（180 aa）	突变：N30D, A49V, I66V, W97R, K131R, W167A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Crystals grown in 20% PEG 3350 and 200mM Ammonium Nitrate and micro seeded into 20% PEG 3350 and 200mM Ammonium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.260
5VCL Structure of the Qdm peptide bound to Qa-1a 提交 2017-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 3–11（9 aa）片段：UNP residues 3-11	未记录	GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；5% polyethylene glycol 1000, 40% ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
8D5N Crystal structure of Ld-HF10 提交 2022-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 25–298（274 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PPI PROPANOIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% w/v PEG10K, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH5.5, and 1M Lithium sulfate monohydrate	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
8D5N Crystal structure of Ld-HF10 提交 2022-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 25–298（274 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% w/v PEG10K, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH5.5, and 1M Lithium sulfate monohydrate	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
8D5Q TCR TG6 in complex with Ld-HF10 提交 2022-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 25–203（179 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11 % w/v PEG 8000, 0.1 M MES 6.0, 0.24 M Ammonium sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.222
8UMO Murine CD94-NKG2A receptor in complex with Qa-1b presenting AMAPRTLLL 提交 2023-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 P 3–11（9 aa）片段：UNP residues 3-11	未记录	BR BROMIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；23% PEG3350 and 0.2M NaBr	分辨率 2.60 Å R-free 0.251

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	HA1L_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–181； UniProt 25–205 作者链 F； PDB构建体 1–181； UniProt 25–205

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2e7l
沉积日期 deposition_date	2007-01-11
结构标题 title	Structure of a high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9
关键词 keywords	TCR, MHC, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.89 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.22 Å
零角强度 I(0) i0	140964000.00
分子量 molecular_weight	92090.0 kDa
排除体积 excluded_volume	113980 Å³
包络体积 envelope_volume	141340 Å³
水化壳体积 shell_volume	37654 Å³
包络直径 envelope_diameter	121.3 Å
壳层 Rg shell_rg	38.17 Å
包络 Rg envelope_rg	31.10 Å
形状 Rg shape_rg	31.17 Å
总 Rg total_rg	31.95 Å
总原子数 total_atoms	6509
残基数 n_residues	814
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	112.8 Å
Rg (实空间) rg_real	31.88 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.06 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4100e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2310e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.89 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	141000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8716
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	36.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.307
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.416
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	22540000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.799; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.956

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytotoxic Tcell receptor
分子量 formula_weight	12698.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6682

QSVTQPDARVTVSEGASLQLRCKYSYSATPYLFWYVQYPRQGPQLLLKYYSGDPVVQGVNGFEAEFSKSNSSFHLRKASVHRSDSAVYFCAVSHQGRYLTFGSGTKVIVLPYN

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-chain
分子量 formula_weight	13268.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

EAAVTQSPRNKVAVTGEKVTLSCNQTNNHNNMYWYRQDTGHELRLIYYSYGAGSTEKGDIPDGYKASRPSQENFSLTLESATPSQTSVYFCASGGGGTLYFGAGTRLSVLSSALEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain
分子量 formula_weight	21205.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

GPHSMRYFETAVSRRGLGEPRYISVGYVDDKEFVRFDSDAENPRYEPQVPWMEQEGPEYWERITQVAKGQEQWFRVNLRTLLGYYNQSAGGTHTLQRMYGCDVGSDGRLLRGYEQFAYDGCDYIALNEDLRTWTAADMAAQITRRKWEQAGAAEYYRAYLEGECVEWLHRYLKNGNATLLR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Peptide (GLN)(LEU)(SER)(PRO)(PHE)(PRO)(PHE)(ASP)(LEU)
分子量 formula_weight	1063.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q

QLSPFPFDL

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	173

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2e7la_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d2e7lb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d2e7lc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d2e7ld_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2e7lA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2e7lB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2e7lC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2e7lD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2e7lE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	2e7lF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	113.540 Å
晶胞边长 b length_b	113.540 Å
晶胞边长 c length_c	177.452 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2251
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	0.2456

fit	/app/data/saxs_computation/e7/2e7l/2e7l.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e7/2e7l/2e7l.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e7/2e7l/2e7l.dat

Structure of a high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytotoxic Tcell receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)