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2eak

Crystal structure of human galectin-9 N-terminal CRD in complex with lactose

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galectin-9

Homo sapiens

UniProt O00182

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 (2S,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2eak 3lsd 3wlu 3wlu 3wlu 3wlu

共 6 个 assembly

同源二聚体
3lsd

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2eak 2eak 2eal 2eal 2yy1 2yy1 2zhk 2zhk 2zhl 2zhl 2zhl 2zhl

共 21 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LEG9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–148； UniProt 1–148 作者链 B； PDB构建体 1–148； UniProt 1–148 作者链 C； PDB构建体 1–148； UniProt 1–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2eak
沉积日期 deposition_date2007-01-31
结构标题 titleCrystal structure of human galectin-9 N-terminal CRD in complex with lactose
关键词 keywordsbeta sandwich, carbohydrate binding protein, galectin, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2eak__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2eak__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2eak__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）15.32 Å
Rg（电子密度）13.78 Å
总 Rg15.09 Å
原子数1106
残基数142
排除体积19567 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2eak__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2eak__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 2eak__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2eaka_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamilyb.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family familyb.29.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2eakb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamilyb.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family familyb.29.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2eakc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamilyb.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family familyb.29.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2eakA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 —
结构域编号 domain_id2eakB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 —
结构域编号 domain_id2eakC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 —
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7. 引用文献 (1)