2esl

Human Cyclophilin C in Complex with Cyclosporin A

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 CALCIUM ION × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CYCLOSPORIN A × 2 CALCIUM ION × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 2 water × 4	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CYCLOSPORIN A × 2 CALCIUM ION × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 2 water × 4	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CYCLOSPORIN A × 2 CALCIUM ION × 1 SULFATE ION × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 CALCIUM ION × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CYCLOSPORIN A × 1 CALCIUM ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	CYCLOSPORIN A × 6 CALCIUM ION × 3 ZINC ION × 2 SULFATE ION × 6 water × 12	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	CYCLOSPORIN A × 3 CALCIUM ION × 1 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 3 water × 6	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	CYCLOSPORIN A × 3 CALCIUM ION × 2 ZINC ION × 1 SULFATE ION × 3 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PPIC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212 作者链 B； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212 作者链 C； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212 作者链 D； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212 作者链 E； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212 作者链 F； PDB构建体 2–190； UniProt 24–212

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2esl
沉积日期 deposition_date	2005-10-26
结构标题 title	Human Cyclophilin C in Complex with Cyclosporin A
关键词 keywords	;ISOMERASE-IMMUNOSUPPRESSANT COMPLEX, CYCLOPHILIN-CYCLOSPORIN COMPLEX, CYCLOSPORIN A, IMMUNOSUPRESSANT, CYCLOPHILIN, SGC, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium ;; ISOMERASE/IMMUNOSUPPRESSANT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2esl__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2esl__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2esl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.59 Å
Rg（电子密度）	15.31 Å
总 Rg	16.58 Å
原子数	1476
残基数	183
排除体积	26635 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2esl__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2esl__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2esl__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2esl__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2esl__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2esl__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2esl__assembly_7__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`2esl__assembly_8__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`2esl__assembly_9__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`2esl__assembly_10__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`2esl__assembly_11__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`2esl__assembly_12__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C
分子量 formula_weight	20542.4 kDa
EC 编号 ec_number	5.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	9659

GSGAEGFRKRGPSVTAKVFFDVRIGDKDVGRIVIGLFGKVVPKTVENFVALATGEKGYGYKGSKFHRVIKDFMIQGGDITTGDGTGGVSIYGETFPDENFKLKHYGIGWVSMANAGPDTNGSQFFITLTKPTWLDGKHVVFGKVIDGMTVVHSIELQATDGHDRPLTNCSIINSGKIDVKTPFVVEIADW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CYCLOSPORIN A
分子量 formula_weight	1220.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L,M,N

ALLVTAGLVLA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	798

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2esla1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

结构域编号 domain_id	d2eslb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

结构域编号 domain_id	d2eslc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

结构域编号 domain_id	d2esld_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

结构域编号 domain_id	d2esle_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

结构域编号 domain_id	d2eslf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.62 — Cyclophilin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.62.1 — Cyclophilin-like
家族 Family family	b.62.1.1 — Cyclophilin (peptidylprolyl isomerase)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2eslA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

结构域编号 domain_id	2eslB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

结构域编号 domain_id	2eslC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

结构域编号 domain_id	2eslD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

结构域编号 domain_id	2eslE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

结构域编号 domain_id	2eslF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	100 — Cyclophilin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cyclophilin-like

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晶胞边长 a length_a	72.203 Å
晶胞边长 b length_b	123.802 Å
晶胞边长 c length_c	135.250 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	36.400 Å
R 因子 r_factor	0.1800
R_work r_work	0.1780
R_free r_free	0.2250

Human Cyclophilin C in Complex with Cyclosporin A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2esl__assembly_2__model_1

2esl__assembly_2__model_1 | I(q)

2esl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Human Cyclophilin C in Complex with Cyclosporin A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2esl__assembly_2__model_1

2esl__assembly_2__model_1 | I(q)

2esl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)