2etn

Crystal structure of Thermus aquaticus Gfh1

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白单体 单体 1 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 1 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 1 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2etn
沉积日期 deposition_date2005-10-27
结构标题 titleCrystal structure of Thermus aquaticus Gfh1
关键词 keywordsanti Gre-factor, RNA polymerase, transcript cleavage, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2etn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2etn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2etn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.75 Å
Rg(电子密度)19.09 Å
总 Rg19.77 Å
原子数1180
残基数154
排除体积20975 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2etn__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2etn__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 2etn__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 2etn__assembly_4__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2etna1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
家族 Family familya.2.1.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd2etna2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.26.1 — FKBP-like
家族 Family familyd.26.1.2 — GreA transcript cleavage factor, C-terminal domain
结构域编号 domain_idd2etnb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
家族 Family familya.2.1.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd2etnb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.26.1 — FKBP-like
家族 Family familyd.26.1.2 — GreA transcript cleavage factor, C-terminal domain
结构域编号 domain_idd2etnc1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
家族 Family familya.2.1.1 — GreA transcript cleavage protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd2etnc2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.26.1 — FKBP-like
家族 Family familyd.26.1.2 — GreA transcript cleavage factor, C-terminal domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id2etnA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2etnA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2etnB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2etnB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2etnC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2etnC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)