2ez5

Solution Structure of the dNedd4 WW3* Domain- Comm LPSY Peptide Complex

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Commissureless LPSY Peptide × 1 （Q24139）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NEDD4_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 6–46； UniProt 526–566

Commissureless LPSY Peptide

物种未注明

UniProt Q24139

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4 × 1 （Q9VVI3）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COMM_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–11； UniProt 227–237

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2ez5
沉积日期 deposition_date	2005-11-10
结构标题 title	Solution Structure of the dNedd4 WW3* Domain- Comm LPSY Peptide Complex
关键词 keywords	Nedd4; WW domain; Commissureless; PY motif; binding affinity, SIGNALLING PROTEIN, LIGASE; SIGNALLING PROTEIN,LIGASE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ez5__assembly_1__model_26

Assembly 1 · Model 26 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ez5__assembly_1__model_26 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ez5__assembly_1__model_26 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	12.78 Å
Rg（电子密度）	11.49 Å
总 Rg	12.89 Å
原子数	871
残基数	57
排除体积	7737 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2ez5__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2ez5__assembly_1__model_2`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2ez5__assembly_1__model_3`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2ez5__assembly_1__model_4`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`2ez5__assembly_1__model_5`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`2ez5__assembly_1__model_6`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`2ez5__assembly_1__model_7`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`2ez5__assembly_1__model_8`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`2ez5__assembly_1__model_9`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`2ez5__assembly_1__model_10`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`2ez5__assembly_1__model_11`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`2ez5__assembly_1__model_12`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`2ez5__assembly_1__model_13`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`2ez5__assembly_1__model_14`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`2ez5__assembly_1__model_15`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`2ez5__assembly_1__model_16`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`2ez5__assembly_1__model_17`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`2ez5__assembly_1__model_18`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`2ez5__assembly_1__model_19`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`2ez5__assembly_1__model_20`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`2ez5__assembly_1__model_21`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`2ez5__assembly_1__model_22`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`2ez5__assembly_1__model_23`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`2ez5__assembly_1__model_24`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`2ez5__assembly_1__model_25`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`2ez5__assembly_1__model_26`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`2ez5__assembly_1__model_27`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`2ez5__assembly_1__model_28`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`2ez5__assembly_1__model_29`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`2ez5__assembly_1__model_30`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2ez5W01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4
分子量 formula_weight	5155.7 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W
原子数 atom_count	26130

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	Commissureless LPSY Peptide
分子量 formula_weight	1203.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Solution Structure of the dNedd4 WW3* Domain- Comm LPSY Peptide Complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Commissureless LPSY Peptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2ez5__assembly_1__model_26

2ez5__assembly_1__model_26 | I(q)

2ez5__assembly_1__model_26 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Solution Structure of the dNedd4 WW3* Domain- Comm LPSY Peptide Complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Commissureless LPSY Peptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2ez5__assembly_1__model_26

2ez5__assembly_1__model_26 | I(q)

2ez5__assembly_1__model_26 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)