2fbw

Avian respiratory complex II with carboxin bound

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 2 UNKNOWN LIGAND × 138 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 1 UNKNOWN LIGAND × 118 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 1 UNDECYL-MALTOSIDE × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1NPJ4_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–621； UniProt 45–665 作者链 N； PDB构建体 1–621； UniProt 45–665

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q9YHT2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 2 UNKNOWN LIGAND × 138 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 1 UNKNOWN LIGAND × 118 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 1 UNDECYL-MALTOSIDE × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SDHB_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–252； UniProt 39–290 作者链 O； PDB构建体 1–252； UniProt 39–290

Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A3Q2U2Y6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 2 UNKNOWN LIGAND × 138 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial × 1 （Q5ZIS0） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 1 UNKNOWN LIGAND × 118 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 1 UNDECYL-MALTOSIDE × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A3Q2U2Y6_CHICK
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 P； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q5ZIS0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 2 UNKNOWN LIGAND × 138 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial × 1 （F1NPJ4） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial × 1 （Q9YHT2） Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial × 1 （A0A3Q2U2Y6） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid × 1 POTASSIUM ION × 1 AZIDE ION × 1 UNKNOWN LIGAND × 118 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1 GLYCEROL × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 1 UNDECYL-MALTOSIDE × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHSD_CHICK
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–103； UniProt 55–157 作者链 Q； PDB构建体 1–103； UniProt 55–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2fbw
沉积日期 deposition_date	2005-12-10
结构标题 title	Avian respiratory complex II with carboxin bound
关键词 keywords	;COMPLEX II, MEMBRANE PROTEIN, HEME PROTEIN, IRON SULFUR PROTEIN, CYTOCHROME B, OXIDOREDUCTASE, REDOX ENZYME, RESPIRATORY CHAIN, OXALOACETATE NITROPROPIONATE UBIQUINONE ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2fbw__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2fbw__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2fbw__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.77 Å
Rg（电子密度）	33.28 Å
总 Rg	33.35 Å
原子数	8993
残基数	1093
排除体积	158340 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2fbw__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2fbw__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	68256.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.3.5.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,N
原子数 atom_count	19296

STKVSDSISTQYPVVDHEFDAVVVGAGGAGLRAAFGLSEAGFNTACVTKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMEDDNWRWHFYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTEQAPAAVIELENYGMPFSRTEEGKIYQRAFGGQSLQFGKGGQAHRCCCVADRTGHSLLHTLYGRSLRYDTSYFVEYFALDLLMENGECRGVIALCIEDGTIHRFRAKNTVIATGGYGRTYFSCTSAHTSTGDGTAMVTRAGLPCQDLEFVQFHPTGIYGAGCLITEGCRGEGGILINSQGERFMERYAPVAKDLASRDVVSRSMTIEIREGRGCGPEKDHVYLQLHHLPPQQLATRLPGISETAMIFAGVDVTKEPIPVLPTVHYNMGGIPTNYKGQVITHVNGEDKVVPGLYACGEAASASVHGANRLGANSLLDLVVFGRACALTIAETCKPGEPVPSIKPNAGEESVANLDKLRFADGTIRTSEARLNMQKTMQSHAAVFRTGSILQEGCEKLSQIYRDLAHLKTFDRGIVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKLRIDEFDYSKPLQGQQKRPFEEHWRKHTLSYVDVKSGKVTLKYRPVIDRTLNEEDCSSVPPAIRSY

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	28685.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.3.5.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,O

AQTAAAATSRIKKFSIYRWDPDKPGDKPRMQTYEVDLNKCGPMVLDALIKIKNELDSTLTFRRSCREGICGSCAMNIAGGNTLACTKKIDPDLSKTTKIYPLPHMYVVKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESKQGKEQYLQSIEDRQKLDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDYTEERLAQLQDPFSLYRCHTIMNCTRTCPKGLNPGKAIAEIKKMMATYKEKAAAA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	15378.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,P

MATTAKEEMARFWEKNTKSSRPLSPHISIYKWSLPMAMSITHRGTGVALSLGVSLFSLAALLLPEQFPHYVAVVKSLSLSPALIYSAKFALVFPLSYHTWNGIRHLVWDMGKGFKLSQVEQSGVVVLILTLLSSAAIAAM

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	10971.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,Q

GSSKAASLHWTSERAVSALLLGLLPAAYLYPGPAVDYSLAAALTLHGHWGLGQVITDYVHGDTPIKVANTGLYVLSAITFTGLCYFNYYDVGICKAVAMLWSI

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	(~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid
分子量 formula_weight	132.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	AZIDE ION
分子量 formula_weight	42.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	UNKNOWN LIGAND
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	256

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	FE3-S4 CLUSTER
分子量 formula_weight	295.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	2-METHYL-N-PHENYL-5,6-DIHYDRO-1,4-OXATHIINE-3-CARBOXAMIDE
分子量 formula_weight	235.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	octyl beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	292.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	UNDECYL-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	496.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1203

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d2fbwb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.4 — 2Fe-2S ferredoxin-like
家族 Family family	d.15.4.2 — 2Fe-2S ferredoxin domains from multidomain proteins

结构域编号 domain_id	d2fbwb2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.2 — alpha-helical ferredoxin
家族 Family family	a.1.2.1 — Fumarate reductase/Succinate dehydogenase iron-sulfur protein, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2fbwc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.21 — Heme-binding four-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	f.21.2 — Fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunits
家族 Family family	f.21.2.2 — Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunits (SdhC/FrdC and SdhD/FrdD)

结构域编号 domain_id	d2fbwd_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.21 — Heme-binding four-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	f.21.2 — Fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunits
家族 Family family	f.21.2.2 — Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunits (SdhC/FrdC and SdhD/FrdD)

结构域编号 domain_id	d2fbwo1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.4 — 2Fe-2S ferredoxin-like
家族 Family family	d.15.4.2 — 2Fe-2S ferredoxin domains from multidomain proteins

结构域编号 domain_id	d2fbwo2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.2 — alpha-helical ferredoxin
家族 Family family	a.1.2.1 — Fumarate reductase/Succinate dehydogenase iron-sulfur protein, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2fbwp_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.21 — Heme-binding four-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	f.21.2 — Fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunits
家族 Family family	f.21.2.2 — Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunits (SdhC/FrdC and SdhD/FrdD)

结构域编号 domain_id	d2fbwq_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.21 — Heme-binding four-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	f.21.2 — Fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunits
家族 Family family	f.21.2.2 — Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunits (SdhC/FrdC and SdhD/FrdD)

CATH v4.4 (15 domains)

结构域编号 domain_id	2fbwA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	700 — Flavocytochrome C3; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein, catalytic domain

结构域编号 domain_id	2fbwA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2fbwA04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	80 — Rhinovirus 14, subunit 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — succinate dehydrogenase protein domain

结构域编号 domain_id	2fbwB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Beta-grasp domain

结构域编号 domain_id	2fbwB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1060 — Fumarate Reductase Iron-sulfur Protein; Chain B, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Alpha-helical ferredoxin

结构域编号 domain_id	2fbwC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	540 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	2fbwD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1300 — 3 helical TM bundles of succinate and fumarate reductases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Fumarate reductase/succinate dehydrogenase, transmembrane subunit

结构域编号 domain_id	2fbwN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	2fbwN02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	700 — Flavocytochrome C3; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein, catalytic domain

结构域编号 domain_id	2fbwN03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2fbwN04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	80 — Rhinovirus 14, subunit 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — succinate dehydrogenase protein domain

结构域编号 domain_id	2fbwO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Beta-grasp domain

结构域编号 domain_id	2fbwO02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1060 — Fumarate Reductase Iron-sulfur Protein; Chain B, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Alpha-helical ferredoxin

结构域编号 domain_id	2fbwP01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	540 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	2fbwQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1300 — 3 helical TM bundles of succinate and fumarate reductases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Fumarate reductase/succinate dehydrogenase, transmembrane subunit

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晶胞边长 a length_a	118.700 Å
晶胞边长 b length_b	200.753 Å
晶胞边长 c length_c	67.631 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.06 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.060 Å
最低分辨率 resolution_low	64.090 Å
R 因子 r_factor	0.1728
R_work r_work	0.1706
R_free r_free	0.2151

Avian respiratory complex II with carboxin bound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2fbw__assembly_2__model_1

2fbw__assembly_2__model_1 | I(q)

2fbw__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 non-polymer

实体 13 Entity 13 non-polymer

实体 14 Entity 14 non-polymer

实体 15 Entity 15 non-polymer

实体 16 Entity 16 non-polymer

实体 17 Entity 17 non-polymer

实体 18 Entity 18 non-polymer

实体 19 Entity 19 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (15 domains)

7. 引用文献 (3)