2fin

Solution Structure of the complex between poxvirus-encoded CC chemokine inhibitor vCCI and human MIP-1beta, ensemble structure

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small inducible cytokine A4

Homo sapiens

UniProt P13236

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 rabbitpox encoded CC chemokine inhibitor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CCL4_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–69; UniProt 24–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2fin
沉积日期 deposition_date2005-12-29
结构标题 titleSolution Structure of the complex between poxvirus-encoded CC chemokine inhibitor vCCI and human MIP-1beta, ensemble structure
关键词 keywordsprotein-protein complex, Chemokine, pox virus, viral CC chemokine inhibitor, VIRUS-VIRAL PROTEIN-CYTOKINE COMPLEX; VIRUS/VIRAL PROTEIN/CYTOKINE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2fin__assembly_1__model_3

Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2fin__assembly_1__model_3 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2fin__assembly_1__model_3 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.49 Å
Rg(电子密度)20.25 Å
总 Rg21.20 Å
原子数4601
残基数311
排除体积41342 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2fin__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2fin__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2fin__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2fin__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2fin__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2fin__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2fin__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2fin__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2fin__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2fin__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2fin__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2fin__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2fin__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2fin__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2fin__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2fina_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.27 — Soluble secreted chemokine inhibitor, VCCI
超家族 Superfamily superfamilyb.27.1 — Soluble secreted chemokine inhibitor, VCCI
家族 Family familyb.27.1.1 — Soluble secreted chemokine inhibitor, VCCI
结构域编号 domain_idd2finb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.9 — IL8-like
超家族 Superfamily superfamilyd.9.1 — Interleukin 8-like chemokines
家族 Family familyd.9.1.1 — Interleukin 8-like chemokines

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2finA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology240 — Viral Chemokine Inhibitor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Major secreted virus protein
结构域编号 domain_id2finB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40

7. 引用文献 (1)