2fmd

Structural basis of carbohydrate recognition by Bowringia milbraedii seed agglutinin

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Lectin

物种未注明

UniProt P42088

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 4 其他聚合物 4 alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose × 4 CALCIUM ION × 4 MANGANESE (II) ION × 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LEC_BOWMI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–240; UniProt 1–240

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2fmd
沉积日期 deposition_date2006-01-09
结构标题 titleStructural basis of carbohydrate recognition by Bowringia milbraedii seed agglutinin
关键词 keywordsLEGUME LECTIN, BETA SANDWICH, PROTEIN-CARBOHYDRATE COMPLEX, lectin, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2fmd__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 排除 — —
排除原因: 聚合物残基中有原子的元素标注存在歧义,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2fmda_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamilyb.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family familyb.29.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2fmdA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 —
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7. 引用文献 (2)