Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ras-related protein Rab-8A × 1 （P55258） ZINC ION × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ras-related protein Rab-8A × 1 （P55258） ZINC ION × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MSS4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–117； UniProt 11–123 作者链 B； PDB构建体 5–117； UniProt 11–123 |
Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Guanine nucleotide exchange factor MSS4 × 1 （P47224） ZINC ION × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Guanine nucleotide exchange factor MSS4 × 1 （P47224） ZINC ION × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RAB8A_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 作者链 D； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183 |
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| 条目编号 entry_id | 2fu5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-01-26 |
| 结构标题 title | structure of Rab8 in complex with MSS4 |
| 关键词 keywords | ;MSS4:Rab8 protein complex, GEF:GTPase nucleotide free complex, nucleotide exchange via unfolding of nucleotide binding region, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.34 Å |
| Rg（电子密度） | 20.19 Å |
| 总 Rg | 21.04 Å |
| 原子数 | 2130 |
| 残基数 | 264 |
| 排除体积 | 37990 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.88 — Mss4-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.88.1 — Mss4-like |
| 家族 Family family | b.88.1.1 — RabGEF Mss4 |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5b2 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.88 — Mss4-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.88.1 — Mss4-like |
| 家族 Family family | b.88.1.1 — RabGEF Mss4 |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5b3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5c1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 家族 Family family | c.37.1.8 — G proteins |
| 结构域编号 domain_id | d2fu5d_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 家族 Family family | c.37.1.8 — G proteins |
| 结构域编号 domain_id | 2fu5A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A |
| 结构域编号 domain_id | 2fu5B00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A |
| 结构域编号 domain_id | 2fu5C00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 2fu5D00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |