2fv7

Crystal structure of human ribokinase

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribokinase

Homo sapiens

UniProt Q9H477

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SODIUM ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 12 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SODIUM ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 12 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RBSK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 20–331; UniProt 11–322 作者链 B; PDB构建体 20–331; UniProt 11–322

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2fv7
沉积日期 deposition_date2006-01-30
结构标题 titleCrystal structure of human ribokinase
关键词 keywordsribokinase, structural genomics, structural genomics consortium, sgc, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2fv7__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 2fv7__assembly_2__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2fv7a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.72 — Ribokinase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.72.1 — Ribokinase-like
家族 Family familyc.72.1.1 — Ribokinase-like
结构域编号 domain_idd2fv7b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.72 — Ribokinase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.72.1 — Ribokinase-like
家族 Family familyc.72.1.1 — Ribokinase-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2fv7A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1190 — UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribokinase
结构域编号 domain_id2fv7B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1190 — UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribokinase
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7. 引用文献 (1)