2g0e

Structure of QacR Multidrug Transcriptional Regulator Bound to Trivalent and Bivalent Diamidine Drugs

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTH-type transcriptional regulator qacR

Staphylococcus haemolyticus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	SULFATE ION × 9 3-[C-[N'-(3-CARBAMIMIDOYL-BENZYLIDENIUM)-HYDRAZINO]-[[AMINOMETHYLIDENE]AMINIUM]-IMINOMETHYL]-BENZAMIDINIUM × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	SULFATE ION × 12 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 16	SULFATE ION × 84 3-[C-[N'-(3-CARBAMIMIDOYL-BENZYLIDENIUM)-HYDRAZINO]-[[AMINOMETHYLIDENE]AMINIUM]-IMINOMETHYL]-BENZAMIDINIUM × 4 water × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	QACR_STAHA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 B； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 D； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 E； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2g0e
沉积日期 deposition_date	2006-02-12
结构标题 title	Structure of QacR Multidrug Transcriptional Regulator Bound to Trivalent and Bivalent Diamidine Drugs
关键词 keywords	helix-turn-helix, transciptional repressor, trivalent, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2g0e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2g0e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2g0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.11 Å
Rg（电子密度）	21.99 Å
总 Rg	23.14 Å
原子数	3165
残基数	372
排除体积	56342 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2g0e__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2g0e__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2g0e__assembly_3__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HTH-type transcriptional regulator qacR
分子量 formula_weight	22154.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,D,E
原子数 atom_count	6357

MNLKDKILGVAKELFIKNGYNATTTGEIVKLSESSKGNLYYHFKTKENLFLEILNIEESKWQEQWKKEQIKAKTNREKFYLYNELSLTTEYYYPLQNAIIEFYTEYYKTNSINEKMNKLENKYIDAYHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIVTFTHEQNINERIKLMNKFSQIFLNGLSK

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus haemolyticus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1283
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	21

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3-[C-[N'-(3-CARBAMIMIDOYL-BENZYLIDENIUM)-HYDRAZINO]-[[AMINOMETHYLIDENE]AMINIUM]-IMINOMETHYL]-BENZAMIDINIUM
分子量 formula_weight	352.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	38

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d2g0ea1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.9 — Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0ea2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.121 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	a.121.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
家族 Family family	a.121.1.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0eb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.9 — Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0eb2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.121 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	a.121.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
家族 Family family	a.121.1.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0ed1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.9 — Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0ed2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.121 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	a.121.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
家族 Family family	a.121.1.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0ee1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family family	a.4.1.9 — Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2g0ee2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.121 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	a.121.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
家族 Family family	a.121.1.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	2g0eA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	2g0eA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

结构域编号 domain_id	2g0eB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	2g0eB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

结构域编号 domain_id	2g0eD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	2g0eD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

结构域编号 domain_id	2g0eE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	2g0eE02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

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晶胞边长 a length_a	170.470 Å
晶胞边长 b length_b	170.470 Å
晶胞边长 c length_c	94.050 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.880 Å
最低分辨率 resolution_low	16.000 Å
R 因子 r_factor	0.2370
R_work r_work	0.2370
R_free r_free	0.2990

Structure of QacR Multidrug Transcriptional Regulator Bound to Trivalent and Bivalent Diamidine Drugs

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTH-type transcriptional regulator qacR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2g0e__assembly_1__model_1

2g0e__assembly_1__model_1 | I(q)

2g0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of QacR Multidrug Transcriptional Regulator Bound to Trivalent and Bivalent Diamidine Drugs

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTH-type transcriptional regulator qacR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2g0e__assembly_1__model_1

2g0e__assembly_1__model_1 | I(q)

2g0e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)