2gtc

Crystal structure of the hypthetical protein from Bacillus cereus (ATCC 14579). Northeast structural genomics Target BcR11

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UPF0145 protein BC_1816

Bacillus cereus ATCC 14579

UniProt Q81EZ2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 5 water × 5 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Y1816_BACCR
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 B; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 C; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 D; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 E; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2gtc
沉积日期 deposition_date2006-04-27
结构标题 titleCrystal structure of the hypthetical protein from Bacillus cereus (ATCC 14579). Northeast structural genomics Target BcR11
关键词 keywordsStructural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, UNKNOWN FUNCTION; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2gtc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2gtc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2gtc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.33 Å
Rg(电子密度)21.41 Å
总 Rg22.09 Å
原子数3840
残基数485
排除体积69351 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2gtc__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd2gtca_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.5 — YbjQ-like
家族 Family familyd.230.5.1 — YbjQ-like
结构域编号 domain_idd2gtcb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.5 — YbjQ-like
家族 Family familyd.230.5.1 — YbjQ-like
结构域编号 domain_idd2gtcc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.5 — YbjQ-like
家族 Family familyd.230.5.1 — YbjQ-like
结构域编号 domain_idd2gtcd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.5 — YbjQ-like
家族 Family familyd.230.5.1 — YbjQ-like
结构域编号 domain_idd2gtce_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.5 — YbjQ-like
家族 Family familyd.230.5.1 — YbjQ-like

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id2gtcA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology110 — Translation Initiation Factor IF3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Hypothetical protein apc22750. Chain B
结构域编号 domain_id2gtcB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology110 — Translation Initiation Factor IF3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Hypothetical protein apc22750. Chain B
结构域编号 domain_id2gtcC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology110 — Translation Initiation Factor IF3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Hypothetical protein apc22750. Chain B
结构域编号 domain_id2gtcD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology110 — Translation Initiation Factor IF3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Hypothetical protein apc22750. Chain B
结构域编号 domain_id2gtcE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology110 — Translation Initiation Factor IF3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Hypothetical protein apc22750. Chain B
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7. 引用文献 (1)