2gvi
Crystal structure of a putative formylmethanofuran dehydrogenase subunit e (ta1109) from thermoplasma acidophilum at 1.87 A resolution
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 4 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2gvi |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-05-02 |
| 结构标题 title | Crystal structure of a putative formylmethanofuran dehydrogenase subunit e (ta1109) from thermoplasma acidophilum at 1.87 A resolution |
| 关键词 keywords | Structural genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Protein Structure Initiative, PSI-2, oxidoreductase; OXIDOREDUCTASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2gvi__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2gvi__assembly_1__model_1 | I(q)
2gvi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 22.74 Å |
| Rg（电子密度） | 21.74 Å |
| 总 Rg | 22.68 Å |
| 原子数 | 3300 |
| 残基数 | 390 |
| 排除体积 | 59056 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2gvia1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.81 — FwdE/GAPDH domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.81.3 — FwdE-like |
| 家族 Family family | d.81.3.1 — FwdE-like |
| 结构域编号 domain_id | d2gvia2 |
| 类 Class class | g — Small proteins |
| 折叠类型 Fold fold | g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 超家族 Superfamily superfamily | g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) |
| 家族 Family family | g.39.1.18 — FwdE C-terminal domain-like |
CATH v4.4 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2gviA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 3320 — pa2218 like fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — pa2218 like domain |
| 结构域编号 domain_id | 2gviA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A; |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Tubulin/FtsZ, C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 2gviA03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |