Lactobacillus plantarum
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | PHOSPHATE ION × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q88YA8_LACPL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–209； UniProt 1–208 |
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| 条目编号 entry_id | 2hdo |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-06-20 |
| 结构标题 title | Crystal structure of putative phosphoglycolate phosphatase (np_784602.1) from Lactobacillus plantarum at 1.50 A resolution |
| 关键词 keywords | ;np_784602.1, putative phosphoglycolate phosphatase, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, HYDROLASE ;; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.40 Å |
| Rg（电子密度） | 16.51 Å |
| 总 Rg | 17.33 Å |
| 原子数 | 1584 |
| 残基数 | 196 |
| 排除体积 | 28295 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2hdoa1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.108 — HAD-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.108.1 — HAD-like |
| 家族 Family family | c.108.1.6 — beta-Phosphoglucomutase-like |
| 结构域编号 domain_id | 2hdoA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1000 — HAD superfamily/HAD-like |
| 结构域编号 domain_id | 2hdoA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA polymerase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 240 — Putative phosphatase; domain 2 |