2hio

HISTONE OCTAMER (CHICKEN), CHROMOSOMAL PROTEIN

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (HISTONE H2A)

物种未注明

UniProt P02263

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 PROTEIN (HISTONE H2B) × 2 (P02279) PROTEIN (HISTONE H3) × 2 (P84229) PROTEIN (HISTONE H4) × 2 (P62801) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A4_CHICK
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–128; UniProt 1–128

PROTEIN (HISTONE H2B)

物种未注明

UniProt P02279

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 PROTEIN (HISTONE H2A) × 2 (P02263) PROTEIN (HISTONE H3) × 2 (P84229) PROTEIN (HISTONE H4) × 2 (P62801) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B_CHICK
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–125; UniProt 1–125

PROTEIN (HISTONE H3)

物种未注明

UniProt P84229

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 PROTEIN (HISTONE H2A) × 2 (P02263) PROTEIN (HISTONE H2B) × 2 (P02279) PROTEIN (HISTONE H4) × 2 (P62801) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H31_CHICK
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

PROTEIN (HISTONE H4)

物种未注明

UniProt P62801

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 PROTEIN (HISTONE H2A) × 2 (P02263) PROTEIN (HISTONE H2B) × 2 (P02279) PROTEIN (HISTONE H3) × 2 (P84229) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H4_CHICK
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2hio
沉积日期 deposition_date1999-06-15
结构标题 titleHISTONE OCTAMER (CHICKEN), CHROMOSOMAL PROTEIN
关键词 keywordsHISTONE, CHROMOSOMAL PROTEIN, STRUCTURAL PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN,DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hio__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hio__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hio__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.65 Å
Rg(电子密度)26.50 Å
总 Rg27.53 Å
原子数5700
残基数724
排除体积102380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2hio__assembly_1__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2hioa_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd2hiob_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd2hioc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd2hiod_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2hioA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
结构域编号 domain_id2hioB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
结构域编号 domain_id2hioC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
结构域编号 domain_id2hioD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A

7. 引用文献 (7)