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2i13

Aart, a six finger zinc finger designed to recognize ANN triplets

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aart

Mus musculus

UniProt Q07230

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*CP*AP*GP*AP*TP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*GP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*GP*CP*CP*CP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*AP*TP*CP*T)-3' × 1 GLYCEROL × 2 ZINC ION × 6 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*CP*AP*GP*AP*TP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*GP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*GP*CP*CP*CP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*AP*TP*CP*T)-3' × 1 GLYCEROL × 2 ZINC ION × 5 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2i13 2i13

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ZSCA2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 18–172； UniProt 218–372

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2i13
沉积日期 deposition_date2006-08-12
结构标题 titleAart, a six finger zinc finger designed to recognize ANN triplets
关键词 keywordsDNA binding, zinc finger, DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2i13__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2i13__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2i13__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）22.18 Å
Rg（电子密度）21.70 Å
总 Rg22.34 Å
原子数2096
残基数195
排除体积33804 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2i13__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2i13__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2i13a1
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.12 — Zinc finger design
超家族 Superfamily superfamilyk.12.1 — Zinc finger design
家族 Family familyk.12.1.1 — Zinc finger design
结构域编号 domain_idd2i13b1
类 Class classk — Designed proteins
折叠类型 Fold foldk.12 — Zinc finger design
超家族 Superfamily superfamilyk.12.1 — Zinc finger design
家族 Family familyk.12.1.1 — Zinc finger design

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id2i13A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2i13A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2i13A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2i13A04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2i13A05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
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7. 引用文献 (1)