2i2r

Crystal structure of the KChIP1/Kv4.3 T1 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Kv channel-interacting protein 1 × 4 （Q9NZI2） ZINC ION × 4 CALCIUM ION × 8 SODIUM ION × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Kv channel-interacting protein 1 × 4 （Q9NZI2） ZINC ION × 4 CALCIUM ION × 8	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Kv channel-interacting protein 1 × 8 （Q9NZI2） ZINC ION × 8 CALCIUM ION × 16 SODIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCND3_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 B； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 C； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 D； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 I； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 J； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 K； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143 作者链 L； PDB构建体 3–144； UniProt 2–143

Kv channel-interacting protein 1

Homo sapiens

UniProt Q9NZI2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 × 4 （Q62897） ZINC ION × 4 CALCIUM ION × 8 SODIUM ION × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 × 4 （Q62897） ZINC ION × 4 CALCIUM ION × 8	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 × 8 （Q62897） ZINC ION × 8 CALCIUM ION × 16 SODIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCIP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 F； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 G； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 H； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 M； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 N； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 O； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227 作者链 P； PDB构建体 1–180； UniProt 48–227

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2i2r
沉积日期 deposition_date	2006-08-16
结构标题 title	Crystal structure of the KChIP1/Kv4.3 T1 complex
关键词 keywords	EF-Hand protein, complex, potassium channel, NCS protein, calcium binding protein, transport protein; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2i2r__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2i2r__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2i2r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.18 Å
Rg（电子密度）	40.90 Å
总 Rg	41.11 Å
原子数	9498
残基数	1208
排除体积	166910 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2i2r__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2i2r__assembly_2__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2i2r__assembly_3__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3
分子量 formula_weight	16807.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,I,J,K,L
原子数 atom_count	18970

GAAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLERYPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKREN

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Kv channel-interacting protein 1
分子量 formula_weight	21029.6 kDa
突变 mutation	K160A, K167A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H,M,N,O,P

EGLEQLEAQTNFTKRELQVLYRGFKNECPSGVVNEDTFKQIYAQFFPHGDASTYAHYLFNAFDTTQTGSVKFEDFVTALSILLRGTVHEKLRWTFNLYDINKDGYINKEEMMDIVKAIYDMMGAYTYPVLAEDTPRQHVDVFFQKMDKNKDGIVTLDEFLESCQEDDNIMRSLQLFQNVM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	2i2rA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	2i2rM00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	2i2rP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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晶胞边长 a length_a	93.151 Å
晶胞边长 b length_b	98.105 Å
晶胞边长 c length_c	97.783 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	91.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.56 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	111.77 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	91.290 Å
R 因子 r_factor	0.2381
R_work r_work	0.2365
R_free r_free	0.2681

Crystal structure of the KChIP1/Kv4.3 T1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Kv channel-interacting protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2i2r__assembly_1__model_1

2i2r__assembly_1__model_1 | I(q)

2i2r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the KChIP1/Kv4.3 T1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Kv channel-interacting protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2i2r__assembly_1__model_1

2i2r__assembly_1__model_1 | I(q)

2i2r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)