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2i91

60kDa Ro autoantigen in complex with a fragment of misfolded RNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein

Xenopus laevis

UniProt P42700

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 5'-R(*GP*CP*CP*UP*AP*CP*CP*C)-3' × 1 5'-R(*C*GP*GP*UP*AP*GP*GP*CP*UP*UP*UP*UP*CP*AP*A)-3' × 1 ACETATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 5'-R(*GP*CP*CP*UP*AP*CP*CP*C)-3' × 1 5'-R(*C*GP*GP*UP*AP*GP*GP*CP*UP*UP*UP*UP*CP*AP*A)-3' × 1 ACETATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1yvr

共 1 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1yvp 1yvp 2i91 2i91

共 4 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RO60_XENLA
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–538； UniProt 1–538 作者链 B； PDB构建体 1–538； UniProt 1–538

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2i91
沉积日期 deposition_date2006-09-04
结构标题 title60kDa Ro autoantigen in complex with a fragment of misfolded RNA
关键词 keywordsvon Willebrand factor A, Rossmann-fold, HEAT repeat, MIDAS motif, RNA Binding Protein-RNA COMPLEX; RNA Binding Protein/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2i91__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2i91__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2i91__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）26.13 Å
Rg（电子密度）25.46 Å
总 Rg26.20 Å
原子数4570
残基数542
排除体积80373 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2i91__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2i91__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2i91a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.25 — TROVE domain-like
家族 Family familya.118.25.1 — TROVE domain-like
结构域编号 domain_idd2i91a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamilyc.62.1 — vWA-like
家族 Family familyc.62.1.5 — RoRNP C-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd2i91b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.25 — TROVE domain-like
家族 Family familya.118.25.1 — TROVE domain-like
结构域编号 domain_idd2i91b2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamilyc.62.1 — vWA-like
家族 Family familyc.62.1.5 — RoRNP C-terminal domain-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2i91A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily410 — von Willebrand factor, type A domain
结构域编号 domain_id2i91B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily410 — von Willebrand factor, type A domain
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7. 引用文献 (1)