SAXSdb — 2iaa

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aromatic Amine Dehydrogenase

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84887） Azurin × 1 （P00281） COPPER (II) ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84887） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Aromatic Amine Dehydrogenase × 2 （P84887） Azurin × 1 （P00281） COPPER (II) ION × 1 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AAUB_ALCFA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–390； UniProt 1–390 作者链 D； PDB构建体 1–390； UniProt 1–390

Aromatic Amine Dehydrogenase

物种未注明

UniProt P84887

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84888） Azurin × 1 （P00281） COPPER (II) ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84888） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Aromatic Amine Dehydrogenase × 2 （P84888） Azurin × 1 （P00281） COPPER (II) ION × 1 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AAUA_ALCFA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–135； UniProt 48–182 作者链 E； PDB构建体 1–135； UniProt 48–182

Azurin

物种未注明

UniProt P00281

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84888） Aromatic Amine Dehydrogenase × 1 （P84887） COPPER (II) ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Aromatic Amine Dehydrogenase × 2 （P84888） Aromatic Amine Dehydrogenase × 2 （P84887） COPPER (II) ION × 1 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AZUR_ALCFA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2iaa
沉积日期 deposition_date	2006-09-07
结构标题 title	Crystal Structure of an Electron Transfer Complex Between Aromatic Amine Dephydrogenase and Azurin from Alcaligenes Faecalis (Form 2)
关键词 keywords	Quinoprotein, tryptophan tryptophylquinone, cupredoxin, electron transfer, OXIDOREDUCTASE-electron transport COMPLEX; OXIDOREDUCTASE/electron transport
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2iaa__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2iaa__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2iaa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.68 Å
Rg（电子密度）	24.90 Å
总 Rg	25.75 Å
原子数	4630
残基数	599
排除体积	81574 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2iaa__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2iaa__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2iaa__assembly_3__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Aromatic Amine Dehydrogenase
分子量 formula_weight	42978.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	9307

MKSKFKLTTAAAMLGLMVLAGGAQAQDKPREVLTGGHSVSAPQENRIYVMDSVFMHLTESRVHVYDYTNGKFLGMVPTAFNGHVQVSNDGKKIYTMTTYHERITRGKRSDVVEVWDADKLTFEKEISLPPKRVQGLNYDGLFRQTTDGKFIVLQNASPATSIGIVDVAKGDYVEDVTAAAGCWSVIPQPNRPRSFMTICGDGGLLTINLGEDGKVASQSRSKQMFSVKDDPIFIAPALDKDKAHFVSYYGNVYSADFSGDEVKVDGPWSLLNDEDKAKNWVPGGYNLVGLHRASGRMYVFMHPDGKEGTHKFPAAEIWVMDTKTKQRVARIPGRDALSMTIDQQRNLMLTLDGGNVNVYDISQPEPKLLRTIEGAAEASLQVQFHPVGGV

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Aromatic Amine Dehydrogenase
分子量 formula_weight	14516.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

AGGGGSSSGADHISLNPDLANEDEVNSCDYWRHCAVDGFLCSCCGGTTTTCPPGSTPSPISWIGTCHNPHDGKDYLISYHDCCGKTACGRCQCNTQTRERPGYEFFLHNDVNWCMANENSTFHCTTSVLVGLAKN

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Azurin
分子量 formula_weight	13711.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

ACDVSIEGNDSMQFNTKSIVVDKTCKEFTINLKHTGKLPKAAMGHNVVVSKKSDESAVATDGMKAGLNNDYVKAGDERVIAHTSVIGGGETDSVTFDVSKLKEGEDYAFFCSFPGHWSIMKGTIELGS

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	989

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d2iaab_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2iaac_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like

结构域编号 domain_id	d2iaae_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	2iaaA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2iaaB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2iaaC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2iaaD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2iaaE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

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晶胞边长 a length_a	67.216 Å
晶胞边长 b length_b	131.722 Å
晶胞边长 c length_c	133.204 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	47.040 Å
R 因子 r_factor	0.1740
R_work r_work	0.1740
R_free r_free	0.2050

Crystal Structure of an Electron Transfer Complex Between Aromatic Amine Dephydrogenase and Azurin from Alcaligenes Faecalis (Form 2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aromatic Amine Dehydrogenase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Aromatic Amine Dehydrogenase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Azurin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2iaa__assembly_1__model_1

2iaa__assembly_1__model_1 | I(q)

2iaa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (2)

Crystal Structure of an Electron Transfer Complex Between Aromatic Amine Dephydrogenase and Azurin from Alcaligenes Faecalis (Form 2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aromatic Amine Dehydrogenase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Aromatic Amine Dehydrogenase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Azurin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2iaa__assembly_1__model_1

2iaa__assembly_1__model_1 | I(q)

2iaa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (2)