2if6

Crystal structure of metalloprotein yiiX from Escherichia coli O157:H7, DUF1105

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein yiiX

Escherichia coli

UniProt Q8X778

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8X778_ECO57
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–186; UniProt 19–202 作者链 B; PDB构建体 3–186; UniProt 19–202

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2if6
沉积日期 deposition_date2006-09-20
结构标题 titleCrystal structure of metalloprotein yiiX from Escherichia coli O157:H7, DUF1105
关键词 keywords;structural genomics, metalloprotein, hypothetical, PSI-2, Protein Structure Initiative, New York SGX Research Center for Structural Genomics, NYSGXRC, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2if6__assembly_1__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 2if6__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2if6a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.21 — YiiX-like
结构域编号 domain_idd2if6b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.21 — YiiX-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2if6A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1720 — endopeptidase fold (from Nostoc punctiforme)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — endopeptidase domain like (from Nostoc punctiforme)
结构域编号 domain_id2if6B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1720 — endopeptidase fold (from Nostoc punctiforme)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — endopeptidase domain like (from Nostoc punctiforme)
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7. 引用文献 (1)