2ixp

Crystal structure of the Pp2A phosphatase activator Ypa1 PTPA1 in complex with model substrate

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 4 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 4 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ixp
沉积日期 deposition_date2006-07-09
结构标题 titleCrystal structure of the Pp2A phosphatase activator Ypa1 PTPA1 in complex with model substrate
关键词 keywords;PP2A PHOSPHATASE ACTIVATOR PROLYL ISOMERASE PTPA, PROLYL CONTAINING PEPTIDE SUBSTRATE ANALOG, NUCLEAR PROTEIN, ISOMERASE-ISOMERASE INHIBITOR COMPLEX ;; ISOMERASE/ISOMERASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ixp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ixp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ixp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.80 Å
Rg(电子密度)26.87 Å
总 Rg27.67 Å
原子数5197
残基数634
排除体积92867 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ixp__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2ixp__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2ixpa1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.268 — PTPA-like
超家族 Superfamily superfamilya.268.1 — PTPA-like
家族 Family familya.268.1.1 — PTPA-like
结构域编号 domain_idd2ixpb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.268 — PTPA-like
超家族 Superfamily superfamilya.268.1 — PTPA-like
家族 Family familya.268.1.1 — PTPA-like
结构域编号 domain_idd2ixpc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.268 — PTPA-like
超家族 Superfamily superfamilya.268.1 — PTPA-like
家族 Family familya.268.1.1 — PTPA-like
结构域编号 domain_idd2ixpd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.268 — PTPA-like
超家族 Superfamily superfamilya.268.1 — PTPA-like
家族 Family familya.268.1.1 — PTPA-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2ixpA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1150 — Phosphotyrosyl phosphate activator, C-terminal lid domain
结构域编号 domain_id2ixpB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1150 — Phosphotyrosyl phosphate activator, C-terminal lid domain
结构域编号 domain_id2ixpC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1150 — Phosphotyrosyl phosphate activator, C-terminal lid domain
结构域编号 domain_id2ixpD02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1150 — Phosphotyrosyl phosphate activator, C-terminal lid domain
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7. 引用文献 (1)