2j4e

THE ITP COMPLEX OF HUMAN INOSINE TRIPHOSPHATASE

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INOSINE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHATASE

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 2 MAGNESIUM ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 1 MAGNESIUM ION × 2 PYROPHOSPHATE 2- × 1 INOSINIC ACID × 1 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ; × 1 MAGNESIUM ION × 2 PYROPHOSPHATE 2- × 1 INOSINIC ACID × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITPA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 B； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 C； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 D； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 E； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 F； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 G； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194 作者链 H； PDB构建体 3–196； UniProt 1–194

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2j4e
沉积日期 deposition_date	2006-08-29
结构标题 title	THE ITP COMPLEX OF HUMAN INOSINE TRIPHOSPHATASE
关键词 keywords	;NUCLEOTIDE METABOLISM, ITP, IMP, HYDROLASE, DISEASE MUTATION, INOSINE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHOHYDROLASE, INOSINE TRIPHOSPHATASE DEFICIENCY ;; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2j4e__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2j4e__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2j4e__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.77 Å
Rg（电子密度）	23.13 Å
总 Rg	23.92 Å
原子数	3029
残基数	380
排除体积	53975 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2j4e__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2j4e__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2j4e__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2j4e__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2j4e__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2j4e__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	INOSINE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHATASE
分子量 formula_weight	21612.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.19
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	12296

GSMAASLVGKKIVFVTGNAKKLEEVVQILGDKFPCTLVAQKIDLPEYQGEPDEISIQKCQEAVRQVQGPVLVEDTCLCFNALGGLPGPYIKWFLEKLKPEGLHQLLAGFEDKSAYALCTFALSTGDPSQPVRLFRGRTSGRIVAPRGCQDFGWDPCFQPDGYEQTYAEMPKAEKNAVSHRFRALLELQEYFGSLAA

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;INOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ;
分子量 formula_weight	508.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PYROPHOSPHATE 2-
分子量 formula_weight	176.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	INOSINIC ACID
分子量 formula_weight	348.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	167

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_id	d2j4ea_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4eb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4ec_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4ed2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4ed3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2j4ee_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4ef_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4eg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j4eh_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.51 — Anticodon-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.51.4 — ITPase-like
家族 Family family	c.51.4.0 — automated matches

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	2j4eA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j4eH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	950 — Maf protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	67.998 Å
晶胞边长 b length_b	75.292 Å
晶胞边长 c length_c	110.793 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	85.12 °
晶胞夹角 β angle_beta	77.72 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	69.19 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	19.810 Å
R 因子 r_factor	0.2040
R_work r_work	0.2010
R_free r_free	0.2650

THE ITP COMPLEX OF HUMAN INOSINE TRIPHOSPHATASE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INOSINE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHATASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2j4e__assembly_2__model_1

2j4e__assembly_2__model_1 | I(q)

2j4e__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

THE ITP COMPLEX OF HUMAN INOSINE TRIPHOSPHATASE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INOSINE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHATASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2j4e__assembly_2__model_1

2j4e__assembly_2__model_1 | I(q)

2j4e__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)