2j4u

E.coli OmpC - camel Lactoferrin complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OUTER MEMBRANE PROTEIN C PRECURSOR

物种未注明

UniProt P06996

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 LACTOTRANSFERRIN × 1 (Q9TUM0) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 LACTOTRANSFERRIN × 1 (Q9TUM0) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OMPC_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367 作者链 Q; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367 作者链 R; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367 作者链 U; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367 作者链 V; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367 作者链 W; PDB构建体 1–346; UniProt 22–367

LACTOTRANSFERRIN

物种未注明

UniProt Q9TUM0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 OUTER MEMBRANE PROTEIN C PRECURSOR × 3 (P06996) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 OUTER MEMBRANE PROTEIN C PRECURSOR × 3 (P06996) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRFL_CAMDR
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–45; UniProt 20–64 作者链 X; PDB构建体 1–45; UniProt 20–64

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2j4u
沉积日期 deposition_date2006-09-06
结构标题 titleE.coli OmpC - camel Lactoferrin complex
关键词 keywords;MEMBRANE PROTEIN/HYDROLASE, MEMBRANE PROTEIN-HYDROLASE COMPLEX, IRON, OMPC, PORIN, COMPLEX, PROTEASE, HYDROLASE, MEMBRANE PROTEIN, ANTIACTERIAL PEPTIDE, ION TRANSPORT, IRON TRANSPORT, SERINE PROTEASE, TRANSPORT, LACTOFERRIN, GLYCOPROTEIN, METAL-BINDING ;; MEMBRANE PROTEIN/HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2j4u__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2j4u__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2j4u__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)32.52 Å
Rg(电子密度)32.22 Å
总 Rg32.99 Å
原子数8267
残基数1056
排除体积143610 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2j4u__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2j4u__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2j4up_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin
结构域编号 domain_idd2j4uq_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin
结构域编号 domain_idd2j4ur_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin
结构域编号 domain_idd2j4uu_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin
结构域编号 domain_idd2j4uv_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin
结构域编号 domain_idd2j4uw_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.4 — Transmembrane beta-barrels
超家族 Superfamily superfamilyf.4.3 — Porins
家族 Family familyf.4.3.1 — Porin

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id2j4uP00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
结构域编号 domain_id2j4uQ00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
结构域编号 domain_id2j4uR00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
结构域编号 domain_id2j4uU00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
结构域编号 domain_id2j4uV00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
结构域编号 domain_id2j4uW00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Porin
▶

7. 引用文献 (1)