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2jmd

Solution Structure of the Ring Domain of Human TRAF6

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TNF receptor-associated factor 6

Homo sapiens

UniProt Q9Y4K3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1lb4 2eci 2jmd

共 3 个 assembly

同源二聚体
3hcs 8hz2

共 2 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1lb5 1lb6 3hct 3hcu 3hcu 4z8m 4z8m 5zuj 6a33 7l3l 7l3l

共 11 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRAF6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 6–63； UniProt 67–124

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jmd
沉积日期 deposition_date2006-11-02
结构标题 titleSolution Structure of the Ring Domain of Human TRAF6
关键词 keywordsProtein, Zinc-binding, human TNF receptor-associated factor 6, Zn2+ coordination, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jmd__assembly_1__model_50

Assembly 1 · Model 50 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jmd__assembly_1__model_50 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jmd__assembly_1__model_50 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）12.41 Å
Rg（电子密度）11.18 Å
总 Rg12.47 Å
原子数976
残基数63
排除体积8803 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jmd__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2jmd__assembly_1__model_2 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2jmd__assembly_1__model_3 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2jmd__assembly_1__model_4 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2jmd__assembly_1__model_5 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2jmd__assembly_1__model_6 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2jmd__assembly_1__model_7 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2jmd__assembly_1__model_8 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2jmd__assembly_1__model_9 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2jmd__assembly_1__model_10 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2jmd__assembly_1__model_11 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2jmd__assembly_1__model_12 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2jmd__assembly_1__model_13 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2jmd__assembly_1__model_14 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2jmd__assembly_1__model_15 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2jmd__assembly_1__model_16 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2jmd__assembly_1__model_17 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2jmd__assembly_1__model_18 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2jmd__assembly_1__model_19 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2jmd__assembly_1__model_20 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 2jmd__assembly_1__model_21 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 2jmd__assembly_1__model_22 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 2jmd__assembly_1__model_23 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 2jmd__assembly_1__model_24 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 2jmd__assembly_1__model_25 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 26 2jmd__assembly_1__model_26 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 27 2jmd__assembly_1__model_27 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 28 2jmd__assembly_1__model_28 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 29 2jmd__assembly_1__model_29 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 2jmd__assembly_1__model_30 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 2jmd__assembly_1__model_31 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 2jmd__assembly_1__model_32 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 2jmd__assembly_1__model_33 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 34 2jmd__assembly_1__model_34 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 35 2jmd__assembly_1__model_35 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 36 2jmd__assembly_1__model_36 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 37 2jmd__assembly_1__model_37 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 38 2jmd__assembly_1__model_38 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 39 2jmd__assembly_1__model_39 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 40 2jmd__assembly_1__model_40 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 2jmd__assembly_1__model_41 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 42 2jmd__assembly_1__model_42 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 43 2jmd__assembly_1__model_43 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 44 2jmd__assembly_1__model_44 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 45 2jmd__assembly_1__model_45 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 46 2jmd__assembly_1__model_46 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 47 2jmd__assembly_1__model_47 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 48 2jmd__assembly_1__model_48 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 49 2jmd__assembly_1__model_49 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 50 2jmd__assembly_1__model_50 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2jmdA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
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7. 引用文献 (1)