2jna

Solution NMR Structure of Salmonella typhimurium LT2 Secreted Protein STM0082: Northeast Structural Genomics Consortium Target StR109

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative secreted protein

Salmonella typhimurium

UniProt Q7CR88

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7CR88_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–96; UniProt 1–96 作者链 B; PDB构建体 1–96; UniProt 1–96

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jna
沉积日期 deposition_date2006-12-31
结构标题 titleSolution NMR Structure of Salmonella typhimurium LT2 Secreted Protein STM0082: Northeast Structural Genomics Consortium Target StR109
关键词 keywords;GFT-NMR, homodimer, PSI-2, alpha+beta, putative secreted protein, Structural Genomics, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jna__assembly_1__model_16

Assembly 1 · Model 16 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jna__assembly_1__model_16 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jna__assembly_1__model_16 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.47 Å
Rg(电子密度)17.20 Å
总 Rg18.22 Å
原子数3200
残基数208
排除体积28335 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jna__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2jna__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2jna__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2jna__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2jna__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2jna__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2jna__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2jna__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2jna__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2jna__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2jna__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2jna__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2jna__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2jna__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2jna__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2jna__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2jna__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2jna__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2jna__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2jna__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2jnaa1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.6 — YdgH-like
家族 Family familyd.230.6.1 — YdgH-like
结构域编号 domain_idd2jnaa2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2jnab2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.230 — Dodecin subunit-like
超家族 Superfamily superfamilyd.230.6 — YdgH-like
家族 Family familyd.230.6.1 — YdgH-like
结构域编号 domain_idd2jnab3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2jnaA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1660 — Dodecin subunit-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Flavin-binding protein dodecin
结构域编号 domain_id2jnaB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1660 — Dodecin subunit-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Flavin-binding protein dodecin
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7. 引用文献 (1)