2jne

NMR structure of E.coli YfgJ modelled with two Zn+2 bound. Northeast Structural Genomics Consortium Target ER317.

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein yfgJ

Escherichia coli

UniProt P76575

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ZINC ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 YFGJ_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 31–101; UniProt 13–83

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jne
沉积日期 deposition_date2007-01-12
结构标题 titleNMR structure of E.coli YfgJ modelled with two Zn+2 bound. Northeast Structural Genomics Consortium Target ER317.
关键词 keywords;C4, C3H, C7H, zinc fingers, two zinc, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, METAL BINDING PROTEIN ;; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jne__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jne__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jne__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.98 Å
Rg(电子密度)13.79 Å
总 Rg14.93 Å
原子数1090
残基数71
排除体积9832 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jne__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2jne__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2jne__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2jne__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2jne__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2jne__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2jne__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2jne__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2jne__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2jne__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2jne__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2jne__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2jne__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2jne__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2jne__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2jne__assembly_1__model_16 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2jne__assembly_1__model_17 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2jne__assembly_1__model_18 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2jne__assembly_1__model_19 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2jne__assembly_1__model_20 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2jnea1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.41.18 — YfgJ-like
家族 Family familyg.41.18.1 — YfgJ-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2jneA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology290 — Rubredoxin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YfgJ-like
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7. 引用文献 (1)