Gag-Pol polyprotein
Human immunodeficiency virus 1
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | POL_HV1Y2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–87； UniProt 278–363 |
2jo0
The solution structure of the monomeric species of the C terminal domain of the CA protein of HIV-1
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2jo0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-02-17 |
| 结构标题 title | The solution structure of the monomeric species of the C terminal domain of the CA protein of HIV-1 |
| 关键词 keywords | HIV, MONOMER, CAPSID PROTEIN, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2jo0__assembly_1__model_14
Assembly 1 · Model 14 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2jo0__assembly_1__model_14 | I(q)
2jo0__assembly_1__model_14 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 14.01 Å |
| Rg（电子密度） | 12.75 Å |
| 总 Rg | 14.15 Å |
| 原子数 | 1345 |
| 残基数 | 87 |
| 排除体积 | 11889 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2jo0__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2jo0__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2jo0__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2jo0__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2jo0__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2jo0__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2jo0__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2jo0__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2jo0__assembly_1__model_9 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2jo0__assembly_1__model_10 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2jo0__assembly_1__model_11 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2jo0__assembly_1__model_12 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2jo0__assembly_1__model_13 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2jo0__assembly_1__model_14 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2jo0__assembly_1__model_15 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 2jo0__assembly_1__model_16 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 2jo0__assembly_1__model_17 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 2jo0__assembly_1__model_18 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 2jo0__assembly_1__model_19 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 2jo0__assembly_1__model_20 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 21 | 2jo0__assembly_1__model_21 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 22 | 2jo0__assembly_1__model_22 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 23 | 2jo0__assembly_1__model_23 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 24 | 2jo0__assembly_1__model_24 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 25 | 2jo0__assembly_1__model_25 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 26 | 2jo0__assembly_1__model_26 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 27 | 2jo0__assembly_1__model_27 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 28 | 2jo0__assembly_1__model_28 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 29 | 2jo0__assembly_1__model_29 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 30 | 2jo0__assembly_1__model_30 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2jo0a1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.28 — Acyl carrier protein-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.28.3 — Retrovirus capsid dimerization domain-like |
| 家族 Family family | a.28.3.1 — Retrovirus capsid protein C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | d2jo0a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2jo0A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Retrovirus capsid C-terminal domain |