2jp9

Structure of the Wilms Tumor Suppressor Protein Zinc Finger Domain Bound to DNA

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Wilms tumor 1

Homo sapiens

UniProt Q4VXV4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*DCP*DGP*DCP*DGP*DGP*DGP*DGP*DGP*DCP*DGP*DTP*DCP*DTP*DGP*DCP*DGP*DC)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*DGP*DCP*DGP*DCP*DAP*DGP*DAP*DCP*DGP*DCP*DCP*DCP*DCP*DCP*DGP*DCP*DG)-3') ; × 1 ZINC ION × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q4VXV4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–119; UniProt 174–291

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jp9
沉积日期 deposition_date2007-04-30
结构标题 titleStructure of the Wilms Tumor Suppressor Protein Zinc Finger Domain Bound to DNA
关键词 keywords;DNA binding, nucleic acid recognition, residual dipolar coupling, zinc finger, Metal-binding, Zinc-finger, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jp9__assembly_1__model_12

Assembly 1 · Model 12 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jp9__assembly_1__model_12 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jp9__assembly_1__model_12 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.10 Å
Rg(电子密度)20.17 Å
总 Rg20.83 Å
原子数3069
残基数153
排除体积27756 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jp9__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2jp9__assembly_1__model_2 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2jp9__assembly_1__model_3 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2jp9__assembly_1__model_4 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2jp9__assembly_1__model_5 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2jp9__assembly_1__model_6 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2jp9__assembly_1__model_7 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2jp9__assembly_1__model_8 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2jp9__assembly_1__model_9 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2jp9__assembly_1__model_10 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2jp9__assembly_1__model_11 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2jp9__assembly_1__model_12 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2jp9__assembly_1__model_13 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2jp9__assembly_1__model_14 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2jp9__assembly_1__model_15 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2jp9__assembly_1__model_16 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2jp9__assembly_1__model_17 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2jp9__assembly_1__model_18 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2jp9__assembly_1__model_19 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2jp9__assembly_1__model_20 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2jp9A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2jp9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2jp9A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
结构域编号 domain_id2jp9A04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
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7. 引用文献 (1)