2ki7

The solution structure of RPP29-RPP21 complex from Pyrococcus furiosus

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonuclease P protein component 1

Pyrococcus furiosus DSM 3638

UniProt Q8U007

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ribonuclease P protein component 4 × 1 (Q8U0H6) ZINC ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RNP1_PYRFU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–127; UniProt 1–127

Ribonuclease P protein component 4

Pyrococcus furiosus DSM 3638

UniProt Q8U0H6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ribonuclease P protein component 1 × 1 (Q8U007) ZINC ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RNP4_PYRFU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–117; UniProt 1–117

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ki7
沉积日期 deposition_date2009-04-28
结构标题 titleThe solution structure of RPP29-RPP21 complex from Pyrococcus furiosus
关键词 keywordsRNase P, Hydrolase, tRNA processing; HYDROLASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ki7__assembly_1__model_10

Assembly 1 · Model 10 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ki7__assembly_1__model_10 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ki7__assembly_1__model_10 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.69 Å
Rg(电子密度)18.89 Å
总 Rg20.01 Å
原子数3589
残基数208
排除体积31569 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ki7__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2ki7__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2ki7__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2ki7__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2ki7__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2ki7__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2ki7__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2ki7__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2ki7__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2ki7__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2ki7A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily210 — Ribonuclease P/MRP, subunit p29
结构域编号 domain_id2ki7B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id2ki7B02
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
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7. 引用文献 (1)