Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | 5'-R(P*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP*AP*UP*AP*AP*U)-3' × 1 Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 4 × 1 （Q99383） | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | RNA15_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–84； UniProt 14–97 |
Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 异源复合物 | 蛋白 2 RNA 1 | 5'-R(P*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP*AP*UP*AP*AP*U)-3' × 1 ;mRNA 3'-end-processing protein RNA15 ; × 1 （P25299） | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | HRP1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–167； UniProt 156–322 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2km8 |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-07-24 |
| 结构标题 title | Interdomain RRM packing contributes to RNA recognition in the rna15, hrp1, anchor RNA 3' processing ternary complex |
| 关键词 keywords | ;3' processing, RRM domain, rna15p, hrp1p, enhancer element, positioning element, RNA recognition, mRNA processing, Nucleus, RNA-binding, Nonsense-mediated mRNA decay, Phosphoprotein, RNA binding protein-RNA COMPLEX ;; RNA binding protein/RNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.98 Å |
| Rg（电子密度） | 20.57 Å |
| 总 Rg | 21.28 Å |
| 原子数 | 4375 |
| 残基数 | 264 |
| 排除体积 | 39288 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2km8__assembly_1__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2km8__assembly_1__model_2 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2km8__assembly_1__model_3 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2km8__assembly_1__model_4 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2km8__assembly_1__model_5 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2km8__assembly_1__model_6 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2km8__assembly_1__model_7 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2km8__assembly_1__model_8 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2km8__assembly_1__model_9 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2km8__assembly_1__model_10 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2km8b_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.7 — RNA-binding domain, RBD, aka RNA recognition motif (RRM) |
| 家族 Family family | d.58.7.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2km8c1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.7 — RNA-binding domain, RBD, aka RNA recognition motif (RRM) |
| 家族 Family family | d.58.7.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2km8c2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.7 — RNA-binding domain, RBD, aka RNA recognition motif (RRM) |
| 家族 Family family | d.58.7.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2km8B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 330 — RRM (RNA recognition motif) domain |
| 结构域编号 domain_id | 2km8C01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 330 — RRM (RNA recognition motif) domain |
| 结构域编号 domain_id | 2km8C02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 330 — RRM (RNA recognition motif) domain |