2l29

Complex structure of E4 mutant human IGF2R domain 11 bound to IGF-II

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin-like growth factor 2 receptor variant

Homo sapiens

UniProt Q59EZ3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Insulin-like growth factor II × 1 (P01344) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q59EZ3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–140; UniProt 1431–1570

Insulin-like growth factor II

Homo sapiens

UniProt P01344

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Insulin-like growth factor 2 receptor variant × 1 (Q59EZ3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGF2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–67; UniProt 25–91

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2l29
沉积日期 deposition_date2010-08-13
结构标题 titleComplex structure of E4 mutant human IGF2R domain 11 bound to IGF-II
关键词 keywordsmannose 6 phosphate receptor, Insulin-like growth factor 2, Genomic imprinting, ligand trap, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2l29__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2l29__assembly_1__model_8 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2l29__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.00 Å
Rg(电子密度)20.16 Å
总 Rg20.91 Å
原子数3146
残基数209
排除体积28218 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2l29__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2l29__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2l29__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2l29__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2l29__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2l29__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2l29__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2l29__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2l29__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2l29__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2l29__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2l29__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2l29__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2l29__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2l29__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2l29__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2l29__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2l29__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2l29__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2l29__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2l29a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.64 — Mannose 6-phosphate receptor domain
超家族 Superfamily superfamilyb.64.1 — Mannose 6-phosphate receptor domain
家族 Family familyb.64.1.1 — Mannose 6-phosphate receptor domain
结构域编号 domain_idd2l29a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2l29b_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.1 — Insulin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.1.1 — Insulin-like
家族 Family familyg.1.1.1 — Insulin-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2l29A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology130 — Cation-dependent Mannose-6-phosphate Receptor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Mannose-6-phosphate receptor binding domain
结构域编号 domain_id2l29B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology100 — Insulin-like, subunit E
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Insulin-like
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7. 引用文献 (1)