Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | NYAD-13 stapled peptide inhibitor × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1Y2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 22–105； UniProt 280–363 |
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| 条目编号 entry_id | 2l6e |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-11-18 |
| 结构标题 title | NMR Structure of the monomeric mutant C-terminal domain of HIV-1 Capsid in complex with stapled peptide Inhibitor |
| 关键词 keywords | Protein-stapled peptide complex, VIRAL PROTEIN - PEPTIDE INHIBITOR complex, VIRAL PROTEIN-INHIBITOR complex; VIRAL PROTEIN/INHIBITOR |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 6 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.96 Å |
| Rg（电子密度） | 14.95 Å |
| 总 Rg | 16.21 Å |
| 原子数 | 1711 |
| 残基数 | 106 |
| 排除体积 | 15067 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2l6e__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2l6e__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2l6e__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2l6e__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2l6e__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2l6e__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2l6e__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2l6e__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2l6e__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2l6e__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2l6e__assembly_1__model_11 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2l6e__assembly_1__model_12 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2l6e__assembly_1__model_13 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2l6e__assembly_1__model_14 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2l6e__assembly_1__model_15 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 2l6e__assembly_1__model_16 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 2l6e__assembly_1__model_17 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 2l6e__assembly_1__model_18 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 2l6e__assembly_1__model_19 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 2l6e__assembly_1__model_20 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2l6ea1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.28 — Acyl carrier protein-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.28.3 — Retrovirus capsid dimerization domain-like |
| 家族 Family family | a.28.3.1 — Retrovirus capsid protein C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | d2l6ea2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 2l6eA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Retrovirus capsid C-terminal domain |