2l6r

High resolution NMR structure of gpW (W protein of bacteriophage lambda) at acidic pH

Method: SOLUTION NMR
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白单体 单体 1 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2l6r
沉积日期 deposition_date2010-11-24
结构标题 titleHigh resolution NMR structure of gpW (W protein of bacteriophage lambda) at acidic pH
关键词 keywordsgpW, atom by atom analysis, fast protein folding, downhill protein folding, folding simulations, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2l6r__assembly_1__model_17

Assembly 1 · Model 17 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2l6r__assembly_1__model_17 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2l6r__assembly_1__model_17 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)15.51 Å
Rg(电子密度)14.42 Å
总 Rg15.53 Å
原子数995
残基数62
排除体积8625 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2l6r__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2l6r__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2l6r__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2l6r__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2l6r__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2l6r__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2l6r__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2l6r__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2l6r__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2l6r__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2l6r__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2l6r__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2l6r__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2l6r__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2l6r__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2l6r__assembly_1__model_16 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2l6r__assembly_1__model_17 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2l6r__assembly_1__model_18 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2l6r__assembly_1__model_19 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2l6ra_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.186 — gpW/XkdW-like
超家族 Superfamily superfamilyd.186.1 — Head-to-tail joining protein W, gpW
家族 Family familyd.186.1.1 — Head-to-tail joining protein W, gpW

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2l6rA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1580 — Head-to-tail joining protein W, gpW
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Head-to-tail joining protein W
▶

7. 引用文献 (1)