Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*CP*AP*AP*AP*TP*AP*AP*AP*AP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*TP*TP*TP*TP*AP*TP*TP*TP*G)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | HXA13_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–71； UniProt 320–386 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2ld5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-05-14 |
| 结构标题 title | Solution NMR-derived complex structure of Hoxa13 DNA binding domain bound to DNA |
| 关键词 keywords | TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 10 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.58 Å |
| Rg（电子密度） | 14.69 Å |
| 总 Rg | 15.70 Å |
| 原子数 | 1450 |
| 残基数 | 89 |
| 排除体积 | 16950 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2ld5__assembly_1__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2ld5__assembly_1__model_2 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2ld5__assembly_1__model_3 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2ld5__assembly_1__model_4 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2ld5__assembly_1__model_5 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2ld5__assembly_1__model_6 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2ld5__assembly_1__model_7 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2ld5__assembly_1__model_8 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2ld5__assembly_1__model_9 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2ld5__assembly_1__model_10 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2ld5a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.1 — Homeodomain-like |
| 家族 Family family | a.4.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2ld5A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Homeodomain-like |