CREB-binding protein
Mus musculus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 586–672 | 片段:KIX DOMAIN | Forkhead box O3 × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2LQI | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1F81 SOLUTION STRUCTURE OF THE TAZ2 DOMAIN OF THE TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR PROTEIN CBP 提交 2000-06-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1764–1850(87 aa)
片段:TAZ2 DOMAIN (1764-1850)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)25 mM;压力 1
NMR样品组成
1.5 mM Taz2 | 25 mM deuterated acetate 0.1 mM ZnCl2 0.1 mM DTT pH 5.9
|
分辨率未提供 |
| 1JJS NMR Structure of IBiD, A Domain of CBP/p300 提交 2001-07-09 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2067–2112(46 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K
|
分辨率未提供 |
| 1KBH Mutual Synergistic Folding in the Interaction Between Nuclear Receptor Coactivators CBP and ACTR 提交 2001-11-06 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2059–2117(59 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.6;31 K;离子强度(mmCIF原始值)60 mM;压力 ambient
NMR样品组成
3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117
6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
95%H2O,5%D2O
NMR样品组成
3mM U-15N,12C-CBP:2059-2117
6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
95%H2O,5%D2O
NMR样品组成
3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117
6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
100%D2O
NMR样品组成
2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088
4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
95%H2O,5%D2O
NMR样品组成
2mM U-15N,12C-ACTR:1018-1088
4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
95%H2O,5%D2O
NMR样品组成
2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088
4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 | 10 mM Tris,
50 mM NaCl
100%D2O
|
分辨率未提供 |
| 1KDX KIX DOMAIN OF MOUSE CBP (CREB BINDING PROTEIN) IN COMPLEX WITH PHOSPHORYLATED KINASE INDUCIBLE DOMAIN (PKID) OF RAT CREB (CYCLIC AMP RESPONSE ELEMENT BINDING PROTEIN), NMR 17 STRUCTURES 提交 1997-09-16 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
586–666(81 aa)
片段:KIX, RESIDUES 586-666
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;315 K;离子强度(mmCIF原始值)0.07;压力 1
NMR样品组成
H2O OR D2O
|
分辨率未提供 |
| 1L8C STRUCTURAL BASIS FOR HIF-1ALPHA/CBP RECOGNITION IN THE CELLULAR HYPOXIC RESPONSE 提交 2002-03-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
345–439(95 aa)
片段:TAZ1 (Transcription activation zinc finger) domain, Residues 345-439
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)2.0 Millimolar;压力 Ambient
NMR样品组成
1MM 13C, 15N-TAZ1, 2MM HIF-1a
NMR样品组成
1MM 13C, 15N-HIF-1a, 2MM TAZ1
NMR样品组成
10MM D-TRIS, 10MM D-DTT, 0.02% NAN3, 0.5MM ZnSO4
|
分辨率未提供 |
| 1SB0 Solution structure of the KIX domain of CBP bound to the transactivation domain of c-Myb 提交 2004-02-09 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
580–666(87 aa)
片段:KIX domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;27 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM;压力 ambient
NMR样品组成
20 mM Tris d11 acetate d4; 50 mM NaCl; 2 mM NaN3; pH 5.5 | 90% H20; 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1TOT ZZ Domain of CBP- a Novel Fold for a Protein Interaction Module 提交 2004-06-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1700–1751(52 aa)
片段:ZZ domain of murine CBP (residues 1700-1751)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM;压力 ambient
NMR样品组成
2.3 mM solutions in degassed 10 mM Tris-d11 pH 6.8, 200 M ZnCl2, 10 mM DTT-d10, 0.05% w/v sodium azide, 94 % H2O, 6 % D2O | 94 % H2O, 6 % D2O
|
分辨率未提供 |
| 1U2N Structure CBP TAZ1 Domain 提交 2004-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
340–439(100 aa)
片段:CBP TAZ1 Domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM;压力 ambient
NMR样品组成
1mM N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT | 90% H2O, 10% 2H2O
NMR样品组成
1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT | 100% 2H2O
NMR样品组成
1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT | 90% H2O, 10% 2H2O
|
分辨率未提供 |
| 2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
586–672(87 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;298 K;压力 1
NMR样品组成
0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
NMR样品组成
13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
NMR样品组成
13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2C52 Structural diversity in CBP p160 complexes 提交 2005-10-25 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2059–2117(59 aa)
片段:SID, RESIDUES 2059-2117
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
NMR样品组成
100% D2O
NMR样品组成
100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KA6 NMR structure of the CBP-TAZ2/STAT1-TAD complex 提交 2008-10-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1764–1855(92 aa)
片段:UNP residues 1764 to 1855
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;290 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] TAZ2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KKJ Solution structure of the Nuclear coactivator binding domain of CBP 提交 2009-06-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2059–2117(59 aa)
片段:Nuclear coactivator binding domain, UNP residues 2059-2441
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;31 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
10 % D2O-1, 20 mM sodium chloride-2, 20 mM sodium phosphate-3, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L14 Structure of CBP nuclear coactivator binding domain in complex with p53 TAD 提交 2010-07-22 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2059–2117(59 aa)
片段:CBP nuclear coactivator binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 15N] p53 TAD, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p53 TAD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LQH NMR structure of FOXO3a transactivation domains (CR2C-CR3) in complex with CBP KIX domain (2b3l conformation) 提交 2012-03-06 | 构建体不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
586–672(87 aa)
片段:KIX domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LWW NMR structure of RelA-TAD/CBP-TAZ1 complex 提交 2012-08-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
340–439(100 aa)
片段:TAZ-type 1 zinc finger residues 340-439
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 ambient
NMR样品组成
0.8-1.1 mM [U-13C; U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.8-1.1 mM [U-13C] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.7-0.9 mM [U-13C] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.7-0.9 mM [U-13C; U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.8-1.1 mM [U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.7-0.9 mM [U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
586–672(87 aa)
片段:UNP residues 562-672, GACKIX domain
|
突变:L664C 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
586–672(87 aa)
片段:UNP residues 562-672, GACKIX domain
|
突变:L664C 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 5HOU Solution Structure of p53TAD-TAZ1 提交 2016-01-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
340–439(100 aa)
片段:p53TAD, TAZ1 domain of CBP
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR测量条件
pH 6.4;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
1.0 mM [U-15N] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5HP0 Solution Structure of TAZ2-p53AD2 提交 2016-01-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1764–1855(92 aa)
片段:p53AD2, TAZ2 domain of CBP
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;305 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR测量条件
pH 6.4;305 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53AD2(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 5 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C] p53AD2, 1 mM TAZ2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
|
分辨率未提供 |
| 5HPD Solution Structure of TAZ2-p53TAD 提交 2016-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1764–1855(92 aa)
片段:p53TAD, TAZ2 domain of CBP
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;305 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR测量条件
pH 6.4;305 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-37, 1 mM p53(38-61), 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 20 mM [U-2H] TRIS, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-37), 1 mM [U-13C] p53(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM TAZ2, 1 mM [U-15N] p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-15N] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
|
分辨率未提供 |
| 5W0I CREBBP Bromodomain in complex with Cpd8 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1083–1198(116 aa)
片段:Bromodomain, UNP residues 1083-1198
|
未记录 | 9UA 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;277 K;0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 23% PEG33500
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.192 |
| 6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
586–672(87 aa)
片段:residues 284-315
链 D
586–672(87 aa)
片段:residues 284-315
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 3350, ammonium iodide
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 G
586–672(87 aa)
片段:residues 284-315
链 I
586–672(87 aa)
片段:residues 284-315
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 3350, ammonium iodide
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 B
586–672(87 aa)
片段:residues 586-672
链 D
586–672(87 aa)
片段:residues 586-672
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 3350, calcium chloride
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.229 |
| 7LVS The CBP TAZ1 Domain in Complex with a CITED2-HIF-1-Alpha Fusion Peptide 提交 2021-02-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
340–439(100 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M HEPES pH 6.87, 28% PEG 4000
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.241 |
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| UniProt名称 | CBP_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–87; UniProt 586–672 |