2m3x

Solution structure of Ph1500: a homohexameric protein centered on a 12-bladed beta-propeller

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PH1500

Pyrococcus horikoshii

UniProt O59169

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O59169_PYRHO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148 作者链 B; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148 作者链 C; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148 作者链 D; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148 作者链 E; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148 作者链 F; PDB构建体 1–147; UniProt 2–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2m3x
沉积日期 deposition_date2013-01-28
结构标题 titleSolution structure of Ph1500: a homohexameric protein centered on a 12-bladed beta-propeller
关键词 keywordsbeta-propeller, 12-bladed, homohexamer, beta-clam, UNKNOWN FUNCTION; UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2m3x__assembly_1__model_6

Assembly 1 · Model 6 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2m3x__assembly_1__model_6 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2m3x__assembly_1__model_6 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.11 Å
Rg(电子密度)38.05 Å
总 Rg38.75 Å
原子数14724
残基数882
排除体积129710 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2m3x__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2m3x__assembly_1__model_2 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2m3x__assembly_1__model_3 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2m3x__assembly_1__model_4 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2m3x__assembly_1__model_5 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2m3x__assembly_1__model_6 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2m3x__assembly_1__model_7 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2m3x__assembly_1__model_8 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2m3x__assembly_1__model_9 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2m3x__assembly_1__model_10 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2m3x__assembly_1__model_11 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2m3x__assembly_1__model_12 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2m3x__assembly_1__model_13 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2m3x__assembly_1__model_14 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2m3x__assembly_1__model_15 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2m3x__assembly_1__model_16 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2m3x__assembly_1__model_17 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2m3x__assembly_1__model_18 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2m3x__assembly_1__model_19 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2m3x__assembly_1__model_20 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id2m3xA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
结构域编号 domain_id2m3xB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
结构域编号 domain_id2m3xC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
结构域编号 domain_id2m3xD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
结构域编号 domain_id2m3xE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
结构域编号 domain_id2m3xF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2m3xF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 —
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7. 引用文献 (2)