2mkn

Structural Characterization of Interactions between the Double-Stranded RNA-Binding Zinc Finger Protein JAZ and dsRNA

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Zinc finger protein 346

Homo sapiens

UniProt Q9UL40

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 ;RNA (5'-R(*GP*CP*CP*GP*UP*GP*GP*UP*CP*UP*GP*GP*UP*GP*GP*CP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*CP*GP*GP*CP*CP*AP*CP*CP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*CP*GP*GP*C)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ZN346_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–60; UniProt 168–227

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2mkn
沉积日期 deposition_date2014-02-10
结构标题 titleStructural Characterization of Interactions between the Double-Stranded RNA-Binding Zinc Finger Protein JAZ and dsRNA
关键词 keywordsZinc finger, dsRNA-binding, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2mkn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2mkn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2mkn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.26 Å
Rg(电子密度)17.82 Å
总 Rg18.43 Å
原子数1681
残基数82
排除体积17939 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2mkn__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2mknA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Classic Zinc Finger
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7. 引用文献 (1)