2n8a

1H, 13C and 15N chemical shift assignments and solution structure for PARP-1 F1F2 domains in complex with a DNA single-strand break

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Poly [ADP-ribose] polymerase 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 1	DNA (45-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PARP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2n8a
沉积日期 deposition_date	2015-10-08
结构标题 title	1H, 13C and 15N chemical shift assignments and solution structure for PARP-1 F1F2 domains in complex with a DNA single-strand break
关键词 keywords	TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2n8a__assembly_1__model_72

Assembly 1 · Model 72 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2n8a__assembly_1__model_72 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2n8a__assembly_1__model_72 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.13 Å
Rg（电子密度）	26.95 Å
总 Rg	27.44 Å
原子数	4788
残基数	259
排除体积	43373 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2n8a__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2n8a__assembly_1__model_2`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2n8a__assembly_1__model_3`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2n8a__assembly_1__model_4`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`2n8a__assembly_1__model_5`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`2n8a__assembly_1__model_6`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`2n8a__assembly_1__model_7`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`2n8a__assembly_1__model_8`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`2n8a__assembly_1__model_9`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`2n8a__assembly_1__model_10`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`2n8a__assembly_1__model_11`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`2n8a__assembly_1__model_12`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`2n8a__assembly_1__model_13`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`2n8a__assembly_1__model_14`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`2n8a__assembly_1__model_15`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`2n8a__assembly_1__model_16`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`2n8a__assembly_1__model_17`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`2n8a__assembly_1__model_18`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`2n8a__assembly_1__model_19`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`2n8a__assembly_1__model_20`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`2n8a__assembly_1__model_21`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`2n8a__assembly_1__model_22`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`2n8a__assembly_1__model_23`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`2n8a__assembly_1__model_24`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`2n8a__assembly_1__model_25`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`2n8a__assembly_1__model_26`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`2n8a__assembly_1__model_27`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`2n8a__assembly_1__model_28`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`2n8a__assembly_1__model_29`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`2n8a__assembly_1__model_30`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	31	`2n8a__assembly_1__model_31`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	32	`2n8a__assembly_1__model_32`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	33	`2n8a__assembly_1__model_33`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	34	`2n8a__assembly_1__model_34`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	35	`2n8a__assembly_1__model_35`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	36	`2n8a__assembly_1__model_36`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	37	`2n8a__assembly_1__model_37`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	38	`2n8a__assembly_1__model_38`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	39	`2n8a__assembly_1__model_39`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	40	`2n8a__assembly_1__model_40`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	41	`2n8a__assembly_1__model_41`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	42	`2n8a__assembly_1__model_42`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	43	`2n8a__assembly_1__model_43`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	44	`2n8a__assembly_1__model_44`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	45	`2n8a__assembly_1__model_45`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	46	`2n8a__assembly_1__model_46`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	47	`2n8a__assembly_1__model_47`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	48	`2n8a__assembly_1__model_48`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	49	`2n8a__assembly_1__model_49`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	50	`2n8a__assembly_1__model_50`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	51	`2n8a__assembly_1__model_51`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	52	`2n8a__assembly_1__model_52`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	53	`2n8a__assembly_1__model_53`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	54	`2n8a__assembly_1__model_54`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	55	`2n8a__assembly_1__model_55`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	56	`2n8a__assembly_1__model_56`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	57	`2n8a__assembly_1__model_57`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	58	`2n8a__assembly_1__model_58`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	59	`2n8a__assembly_1__model_59`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	60	`2n8a__assembly_1__model_60`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	61	`2n8a__assembly_1__model_61`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	62	`2n8a__assembly_1__model_62`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	63	`2n8a__assembly_1__model_63`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	64	`2n8a__assembly_1__model_64`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	65	`2n8a__assembly_1__model_65`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	66	`2n8a__assembly_1__model_66`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	67	`2n8a__assembly_1__model_67`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	68	`2n8a__assembly_1__model_68`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	69	`2n8a__assembly_1__model_69`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	70	`2n8a__assembly_1__model_70`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	71	`2n8a__assembly_1__model_71`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	72	`2n8a__assembly_1__model_72`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	73	`2n8a__assembly_1__model_73`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	74	`2n8a__assembly_1__model_74`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	75	`2n8a__assembly_1__model_75`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	76	`2n8a__assembly_1__model_76`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	77	`2n8a__assembly_1__model_77`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	78	`2n8a__assembly_1__model_78`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Poly [ADP-ribose] polymerase 1
分子量 formula_weight	24106.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.2.30
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	373464

MAESSDKLYRVEYAKSGRASCKKCSESIPKDSLRMAIMVQSPMFDGKVPHWYHFSCFWKVGHSIRHPDVEVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVTGKGQDGIGSKAEKTLGDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQVRLSKKMVDPEKPQLGMIDRWYHPGCFVKNREELGFRPEYSASQLKGFSLLATEDKEALKKQLPGVKSEGKRKGDEVD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA (45-MER)
分子量 formula_weight	13871.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	B

GCTGGCTTCGTAAGAAGCCAGCTCGCGGTCAGCTTGCTGACCGCG

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2n8aA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1740 — first zn-finger domain of poly(adp-ribose) polymerase-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, PARP-type

结构域编号 domain_id	2n8aA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1740 — first zn-finger domain of poly(adp-ribose) polymerase-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, PARP-type

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1H, 13C and 15N chemical shift assignments and solution structure for PARP-1 F1F2 domains in complex with a DNA single-strand break

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Poly [ADP-ribose] polymerase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2n8a__assembly_1__model_72

2n8a__assembly_1__model_72 | I(q)

2n8a__assembly_1__model_72 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)