2nv2

Structure of the PLP synthase complex Pdx1/2 (YaaD/E) from Bacillus subtilis

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pyridoxal biosynthesis lyase pdxS

Bacillus subtilis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Glutamine amidotransferase subunit pdxT × 12 （P37528） CHLORIDE ION × 12 1,2-ETHANEDIOL × 18 GLUTAMINE × 12 water × 24	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PDXS_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 C； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 E； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 G； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 I； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 K； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 M； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 O； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 Q； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 S； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 U； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293 作者链 W； PDB构建体 1–294； UniProt 0–293

Glutamine amidotransferase subunit pdxT

Bacillus subtilis

UniProt P37528

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Pyridoxal biosynthesis lyase pdxS × 12 （P37527） CHLORIDE ION × 12 1,2-ETHANEDIOL × 18 GLUTAMINE × 12 water × 24	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PDXT_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 D； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 F； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 H； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 J； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 L； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 N； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 P； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 R； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 T； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 V； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 X； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2nv2
沉积日期 deposition_date	2006-11-10
结构标题 title	Structure of the PLP synthase complex Pdx1/2 (YaaD/E) from Bacillus subtilis
关键词 keywords	(beta/alpha)8-barrel, 3-Layer(aba) Sandwich, PLP synthase complex, LYASE-TRANSFERASE COMPLEX; LYASE/TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2nv2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2nv2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2nv2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.76 Å
Rg（电子密度）	59.31 Å
总 Rg	59.29 Å
原子数	42086
残基数	5554
排除体积	751780 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2nv2__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Pyridoxal biosynthesis lyase pdxS
分子量 formula_weight	31649.6 kDa
EC 编号 ec_number	4.-.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W
原子数 atom_count	48293

MAQTGTERVKRGMAEMQKGGVIMDVINAEQAKIAEEAGAVAVMALERVPADIRAAGGVARMADPTIVEEVMNAVSIPVMAKARIGHIVEARVLEAMGVDYIDESEVLTPADEEFHLNKNEYTVPFVCGCRDLGEATRRIAEGASMLRTKGEPGTGNIVEAVRHMRKVNAQVRKVVAMSEDELMTEAKNLGAPYELLLQIKKDGKLPVVNFAAGGVATPADAALMMQLGADGVFVGSGIFKSDNPAKFAKAIVEATTHFTDYKLIAELSKELGTAMKGIEISNLLPEQRMQERGW

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Glutamine amidotransferase subunit pdxT
分子量 formula_weight	22517.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.6.-.-
突变 mutation	H170N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X

MLTIGVLGLQGAVREHIHAIEACGAAGLVVKRPEQLNEVDGLILPGGESTTMRRLIDTYQFMEPLREFAAQGKPMFGTCAGLIILAKEIAGSDNPHLGLLNVVVERNSFGRQVDSFEADLTIKGLDEPFTGVFIRAPHILEAGENVEVLSEHNGRIVAAKQGQFLGCSFNPELTEDHRVTQLFVEMVEEYKQKALVLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLUTAMINE
分子量 formula_weight	146.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5774

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_id	d2nv2a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2c_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2d_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2e_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2f_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2g_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2h_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2i_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2j_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2k_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2l_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2m_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2n_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2o_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2p_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2q_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2r_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2s_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2t_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2u_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2v_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

结构域编号 domain_id	d2nv2w_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.2 — Ribulose-phoshate binding barrel
家族 Family family	c.1.2.6 — PdxS-like

结构域编号 domain_id	d2nv2x_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family family	c.23.16.1 — Class I glutamine amidotransferases (GAT)

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	2nv2A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2F00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2G00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2H00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2I00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2J00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2K00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2L00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2M00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2N00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2O00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2P00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2Q00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2R00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2S00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2T00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2U00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2V00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

结构域编号 domain_id	2nv2W00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	2nv2X00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain

▶

晶胞边长 a length_a	93.507 Å
晶胞边长 b length_b	259.009 Å
晶胞边长 c length_c	144.962 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.13 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.120 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.1487
R_work r_work	0.1461
R_free r_free	0.1979

Structure of the PLP synthase complex Pdx1/2 (YaaD/E) from Bacillus subtilis

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pyridoxal biosynthesis lyase pdxS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Glutamine amidotransferase subunit pdxT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2nv2__assembly_1__model_1

2nv2__assembly_1__model_1 | I(q)

2nv2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the PLP synthase complex Pdx1/2 (YaaD/E) from Bacillus subtilis

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pyridoxal biosynthesis lyase pdxS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Glutamine amidotransferase subunit pdxT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2nv2__assembly_1__model_1

2nv2__assembly_1__model_1 | I(q)

2nv2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)