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2nwx

Crystal structure of GltPh in complex with L-aspartate and sodium ions

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

425aa long hypothetical proton glutamate symport protein

Pyrococcus horikoshii

UniProt O59010

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 SODIUM ION × 6 ASPARTIC ACID × 3 PALMITIC ACID × 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
6wyj 6wyk 7ug0 7ugd 7ugj 7ugv 7ugx 7uh3 7uh6 9bh1 9bh2

共 11 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1xfh 2nwl 2nww 2nwx 3kbc 3v8f 3v8g 3v8g 4izm 4oye 4oye 4p19

共 29 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O59010_PYRHO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417 作者链 B； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417 作者链 C； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2nwx
沉积日期 deposition_date2006-11-16
结构标题 titleCrystal structure of GltPh in complex with L-aspartate and sodium ions
关键词 keywords;amino acid transporter, transmembrane transporter, aspartate transporter, binding site, sodium binding, substrate binding, TRANSPORT PROTEIN ;; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2nwx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2nwx__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2nwx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）34.02 Å
Rg（电子密度）33.33 Å
总 Rg33.92 Å
原子数8593
残基数1197
排除体积157930 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2nwx__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2nwxa1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.49 — Proton glutamate symport protein
超家族 Superfamily superfamilyf.49.1 — Proton glutamate symport protein
家族 Family familyf.49.1.1 — Proton glutamate symport protein
结构域编号 domain_idd2nwxb1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.49 — Proton glutamate symport protein
超家族 Superfamily superfamilyf.49.1 — Proton glutamate symport protein
家族 Family familyf.49.1.1 — Proton glutamate symport protein
结构域编号 domain_idd2nwxc1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.49 — Proton glutamate symport protein
超家族 Superfamily superfamilyf.49.1 — Proton glutamate symport protein
家族 Family familyf.49.1.1 — Proton glutamate symport protein

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2nwxA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3860 — Proton glutamate symport protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium:dicarboxylate symporter
结构域编号 domain_id2nwxB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3860 — Proton glutamate symport protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium:dicarboxylate symporter
结构域编号 domain_id2nwxC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3860 — Proton glutamate symport protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium:dicarboxylate symporter
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7. 引用文献 (1)